Benutzerhandbuch für das BD MAX™ System
Wellenlänge
Ein schreibgeschütztes Feld, in dem die Kanalwellenlänge in nm angezeigt wird.
Alias
In diesem Feld können Sie einen benutzerdefinierten Wert für den Kanal festlegen.
Klicken Sie in das Feld, um einen Wert für das Alias einzugeben, das bis zu sieben
alphanumerische Zeichen (z. B. Name des Farbstoffs, Organismus usw.) enthalten kann.
Nur ein Alias kann pro Kanal zugewiesen werden, unabhängig davon, ob PCR und/oder
Schmelz aktiviert ist. Das Alias ersetzt die Wellenlängenbeschriftung in den Anzeigen
„PCR", „Schmelz" und „Quantifizierung" sowie in den entsprechenden Berichten.
Schmelz-Verstärkung
Mit dem Feld „Schmelz-Verstärkung" können Sie die Energiestufe für diese Wellenlänge
ändern. Markieren Sie den angezeigten Wert und geben Sie den gewünschten Wert
(zwischen 0 und 100) ein oder klicken Sie auf die Schaltfläche „+" oder „-", um den
Amplifikationswert zu erhöhen oder zu verringern (in 10er-Schritten). Der Standardwert
ist 0. Die Schmelz-Verstärkung muss größer als 0 sein, um einen Nur-Schmelz-Test
speichern zu können.
Nachdem einem Kanal eine Schmelz-Verstärkung zugewiesen wurde, werden die Felder
„Scheitelrichtung", „Empfindlichkeit" und „Schmelz-Behälter" aktiv.
Höchstwertrichtung
Im Feld „Scheitelrichtung" können Sie die erwartete Richtung der Schmelzkurve
konfigurieren.
Das negative erste Derivat der Fluoreszenzänderung (-d(RFU)/dT) wird in Abhängigkeit
von der Temperatur dargestellt. Die häufigsten Nachweismethoden führen zu einer
Reduzierung des Fluoreszenzsignals, da die Temperatur steigt und sich
Nukleinsäurestränge trennen. Das negative erste Derivat weist eine oder mehrere
deutliche Spitzen bei der Schmelztemperatur (Tm) jedes Produkts in der Reaktion auf.
Durch die Auswahl der „Scheitelrichtung" ändert sich das Verhalten des Algorithmus für
die Darstellung der endgültigen Tm-Werte.
•
Die Standardeinstellung ist „Spitze". Durch die Auswahl von „Spitze" als
„Scheitelrichtung" werden diese Spitzen für die Darstellung der endgültigen Tm-Werte
verwendet.
Wenn die Nachweismethode dazu führt, dass sich das Fluoreszenzsignal bei steigender
Temperatur erhöht, dann werden die Schmelztemperaturen durch die Kurve des
negativen ersten Derivats als umgekehrte Spitzen (oder Senken) dargestellt.
•
Durch die Auswahl von „Senke" als „Scheitelrichtung" werden diese umgekehrten
Spitzen für die Darstellung der endgültigen Tm-Werte verwendet.
Sensitivität
Im Feld „Empfindlichkeit" können Sie die Empfindlichkeit des Schmelz-Algorithmus
steuern. Die Empfindlichkeit kann durch die Verwendung einer von drei Einstellungen
angepasst werden.
•
Empfindlichkeitsprofil „Niedrig": Nur große, klar definierte Spitzen ergeben einen
endgültigen Tm-Wert in der Ausgabe.
•
Empfindlichkeitsprofil „Normal": Diese Einstellung gleicht die Notwendigkeit, Tm-Werte
abzurufen, die aus kleineren Fluoreszenzänderungen herrühren, mit der Notwendigkeit,
geringfügige Änderungen zu ignorieren, die nicht mit der Denaturierung der
Nukleinsäure in Beziehung stehen, aus.
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