B Glossar - Cepheid Genexpert Dx System Handbuch

B Glossar

.gxa/.nxa-Datei – eine Assay-Definitionsdatei.
.gxr/.nxr-Datei – eine chargenspezifische Parameterdatei.
.gxx/.nxx-Datei – eine Archivdatei, die mehrere Tests enthält.
ADF –
ADK –
ADS –
ASK –
Amplifikationskurve – ein Graph, in dem die Anzahl von PCR-Zyklen gegen die
detektierten Fluoreszenzwerte abgetragen ist. Eine Echtzeit-Amplifikationskurve ist durch
drei verschiedene Phasen gekennzeichnet: Grundlinie, log-linear und Plateau. Der Anstieg
der Fluoreszenz ist proportional zu der Menge des erzeugten Amplikons und kann zur
Bestimmung des Schwellenwert-Zyklus verwendet werden.
Assay-Definition – eine Serie programmierter Schritte zur Durchführung der
Probenvorbereitung, Amplifikation und Detektion.
Chargenspezifische Parameter (Lot Specific Parameters, LSP) –
Informationen über eine Reagenziencharge, die von bestimmten Assay-Definitionen
benötigt werden, um die Testergebnisse zu bestimmen. Die chargenspezifischen Parameter
sind in den 2D-Barcodes der GeneXpert Kartusche und in den chargenspezifischen
Parameterdateien (.gxr/.nxr) enthalten.
Datenreduktion – der Prozess, bei dem das System die Rohdaten anhand der
Einstellungen in der Assay-Definition analysiert, um das Testergebnis zu ermitteln.
DMS (Data Management System) – könnte ein kleineres, selbstständiges
Informationssystem sein oder ein LIS in der gleichen Einrichtung ergänzen. Ein DMS ist
eine Softwareanwendung zum Empfangen, Verarbeiten und Speichern von Informationen.
Endogene Kontrolle – Eine Kontrolle (Kontrollgen) aus der Testprobe, die dazu dient,
Zielsequenzen zu normalisieren, und/oder die sicherstellen soll, dass ausreichend
Probenmaterial für den Test verwendet wird.
Endpunkt – der Fluoreszenzwert des letzten Zyklus eines Thermocycling-Protokolls.
Instrumentenmodul – eine individuelle Hardware-Komponente, in der die Fluidik-
und Thermocycling-Protokolle ablaufen. Jedes Modul besteht aus einem Fach für die
Kartusche, einem Pumpenantrieb, einem Ventilantrieb, einer Sonotrode und einem
I-CORE-Modul.
Benutzerhandbuch für das GeneXpert Dx System
303-1548-DE, Rev. A 2023-07
Assay-Definitionsdatei (ADF)
Assay-Entwicklungskit (Assay Development Kit)
Assay-Entwicklungspaket (Assay Development Suite)
Assay-Support-Kit (Assay Support Kit)
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