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Durchführen Der Merkmalsextraktion Bei Gescannten Bildern - Agilent Technologies G4900DA SureScan Benutzerhandbuch

Microarray-scannersystem
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Durchführen der Merkmalsextraktion bei gescannten Bildern
Das
Merkmalsextraktionsprogramm
wurde auf Ihrem
Scannerarbeitsstation
vorinstalliert.
Das Agilent
CytoGenomics-Programm ist im
SureScan-System nicht enthalten.
SureScan-System Benutzerhandbuch
Dialogfeld „Settings" – „Design To Protocol Mapping"
Es gibt mehrere Möglichkeiten zur Durchführung der
Merkmalsextraktion für die gescannten Bilddateien, die von
Ihrem Scanner erstellt wurden:
• Richten Sie das Scan-Steuerungsprogramm so ein, dass die
Merkmalsextraktion automatisch beim Scan-Vorgang der
Objektträger durchgeführt wird. Siehe
Speicherort für das Merkmalsextraktionsprogramm fest"
Seite 65 und
„So legen Sie die Ausführung des
Merkmalsextraktionsprogramm nach einem Scan-Vorgang
fest"
auf Seite 66. Das Scan-Steuerungsprogramm erstellt
automatisch eine Projektdatei, die zum Extrahieren der
Bildmerkmale nach dem Scan-Vorgang verwendet wird. Die
Datenbank für die Merkmalsextraktion muss das Design (das
Raster) für das Bild enthalten, oder Sie müssen das
Merkmalsextraktionsprogramm so konfigurieren, dass der
eArray-Server während der Extraktion verwendet wird.
• Führen Sie das Merkmalsextraktionsprogramm manuell nach
der Erstellung der gescannten Bilder aus. Informationen zur
Verwendung des Merkmalsextraktionsprogramms finden Sie
in der Dokumentation, die dem Programm beiliegt.
• Um Agilent CytoGenomics zum Extrahieren der
Bildmerkmale zu verwenden, stellen Sie den Ausgabeordner
auf den TIFF-Bildordner für die automatische Verarbeitung
ein, der im Agilent CytoGenomics-Programm konfiguriert
wurde. Das CytoGenomics-Programm sucht die Bilder
automatisch heraus, extrahiert die Merkmale und analysiert
sie anschließend. Weitere Informationen hierzu finden Sie in
der Dokumentation zum Agilent CytoGenomics-Programm.
Referenz
„So legen Sie den
auf
131
6

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