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Arbeitsweise; Positionierung Der Objektträger; Laseranregung; Scannen - Agilent Technologies G4900DA SureScan Benutzerhandbuch

Microarray-scannersystem
Inhaltsverzeichnis

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Einführung
Positionierung der Objektträger

Arbeitsweise

Positionierung der Objektträger

Laseranregung

Scannen

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In diesem Abschnitt werden die Betriebsfunktionen des
SureScan-Scanners beschrieben.
Der SureScan-Scanner kann in seiner nicht herausnehmbaren
Kassette bis zu 24 Objektträger der Größe 76 mm x 26 mm
aufnehmen. Während eines Scan-Vorgangs werden die
Objektträger nacheinander in die Position zum Scannen
gebracht, gescannt und dann zurück in die Kassette befördert.
Der SureScan-Scanner arbeitet mit zwei Lasern, einem grünen
diodengepumpten Festkörperlaser (532 nm) und einem roten
Diodenlaser (640 nm). Die Laser regen mit Cyanine-3 (Cy-3)
und Cyanine-5 (Cy-5) markierte RNA oder DNA an, um die
Fluoreszenz nach der Hybridisierung der Zielnukleinsäure auf
den Microarray-Sonden zu messen. Farbstoffe, die Cy-3 und
Cy-5 ähneln wie z.B. die Farbstoffe Alexa 647, 555 und 660,
können ebenfalls verwendet werden.
Der SureScan-Scanner wurde für einen großen Störabstand in den
Emissionsbanden Cy-3 (550 - 610 nm) und Cy-5 (650 - 750 nm)
optimiert. Er verfügt über einen weiten Dynamikbereich mit
geringem spektralem Übersprechen, was die die Messung von
zahlreichen Zielkonzentrationen ermöglicht und für eine höhere
Datenzuverlässigkeit bei niedrigeren Frequenzen sorgt.
Die Laseranregung wird schnell über das Microarray vor und
zurück gescannt. Der dynamische Autofokus sorgt dafür, dass
das Microarray immer in der Brennebene der Scan-Linse
positioniert ist, um Gleichmäßigkeit und eine Kalibration der
Intensität beim Scannen sicherzustellen.
SureScan-System Benutzerhandbuch

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