13. Verschließen Sie die PCR-Platte (oder -Streifen) mit
PCR-Deckelstreifen.
14. Schütteln Sie die PCR-Platte für 5–10 Min. bei 1400 UpM und
Raumtemperatur (15–25 °C).
Sepharose-Beads sedimentieren relativ schnell. Die Bindung der
Oligos an die Beads (Immobilisierung) muss daher sofort nach dem
Schütteln der PCR-Platte durchgeführt werden.
Während dieses Arbeitsschritts können Sie die PyroMark Q24 MDx
Vakuum-Arbeitsstation für die Probenverarbeitung vorbereiten (siehe
Anhang A auf Seite 44 f.).
15. Geben Sie 25 µl PyroMark Annealing-Puffer in jedes Well der
PyroMark Q24 Platte, das für die Probenvorbereitung des immo-
bilisierten PyroMark Q24 Kontroll-Oligonukleotids mit der PyroMark
Q24 MDx Vakuum-Arbeitsstation verwendet wird. Geben Sie gemäß
der Laufkonfiguration 25 µl des verdünnten PyroMark Q24 Kontroll-
Oligonukleotids (Konzentration: 0,04 µM) in acht zusätzliche Wells.
Halten Sie einen der PyroMark Q24 Platten-Halter (mit der
PyroMark Q24 MDx Vakuum-Arbeitsstation geliefert) bei Raumtemperatur
(15–25 °C) bereit, und benutzen Sie ihn als Halter bei der Vorbereitung und
zum Transportieren der Platte.
16. Setzen Sie die PCR-Platte (oder -Streifen) und die PyroMark Q24
Platte auf die Arbeitsplattform der PyroMark Q24 MDx Vakuum -
Arbeitsstation (siehe Abbildung 9).
Stellen Sie sicher, dass die Platte genauso ausgerichtet ist wie bei
der Beschickung mit den Proben.
Abbildung 9. Positionierung der PCR-Platte (oder -Streifen) und der PyroMark
Q24 Platte in der PyroMark Q24 MDx Vakuum-Arbeitsstation. Die gekennzeich-
neten Positionen enthalten: 70 % Ethanol (1), PyroMark Denaturierungslösung (2),
PyroMark Waschpuffer (3) und hochreines Wasser (4, 5). P: Park-Position.
17. Legen Sie Unterdruck an den Saugkopf an, indem Sie den
Vakuumschalter öffnen.
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PyroMark Q24 Control Oligo Handbuch 03/2015