Konfigurieren Der Sekundäranalyse - illumina NextSeq 2000 Handbuch

NextSeq 2000-Sequenziersystem Handbuch
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Wählen Sie Import Data (Daten importieren) und anschließend das Probenblatt. Stellen Sie
sicher, dass die im Probenblatt „BCLConvert_Data" angegebenen Indexsequenzen mit dem
im NextSeq 2000 gewählten Index-Kit übereinstimmen und dass Ihr Probenblatt richtig
formatiert ist. Siehe
am Probenblatt nach dem ersten Download können zu einem Fehlschlagen der Analyse
führen.
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Geben Sie Proben-IDs und entsprechende Well-Positionen oder Indizes manuell ein. Wenn
für das Bibliotheksvorbereitungskit „Not Specified" (Nicht angegeben) ausgewählt ist,
müssen Index 2-Sequenzen in Vorwärtsrichtung eingegeben werden.
12. Wählen Sie Next (Weiter).
Konfigurieren der Sekundäranalyse
Konfigurieren Sie die Einstellungen des für den Lauf ausgewählten Analysetyps.
Illumina DRAGEN BCL Convert
Konfigurieren Sie die Illumina DRAGEN BCL Convert-Analyse anhand der folgenden Schritte.
1. Geben Sie die folgenden optionalen Einstellungen ein.
Einstellung
AdapterRead1
AdapterRead2
BarcodeMismatchesIndex1
BarcodeMismatchesIndex2
OverrideCycles
2. Stellen Sie die Laufkonfiguration fertig.
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Wählen Sie Submit Run (Lauf absenden), um die Laufkonfiguration an Ihr BaseSpace
Sequence Hub-Konto zu senden. An BaseSpace Sequence Hub gesendete Läufe werden in
der Liste mit den geplanten Läufen angezeigt und sind im Cloud-Modus und im Hybrid-Modus
für Systeme verfügbar.
Dokument-Nr. 1000000109376 v01 DEU
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in Diagnoseverfahren.
Einstellungen für Probenblätter der Version 2 auf Seite
Beschreibung
Adaptersequenz für Read 1. Lassen Sie das Feld „AdapterRead1"
frei, wenn Sie ein Illumina-Bibliotheksvorbereitungskit verwenden.
Adaptersequenz für Read 2. Lassen Sie das Feld „AdapterRead2"
frei, wenn Sie ein Illumina-Bibliotheksvorbereitungskit verwenden.
Die Anzahl der zulässigen Nichtübereinstimmungen zwischen dem
ersten Index-Read und der Indexsequenz. Der Standardwert ist 1.
Die Anzahl der zulässigen Nichtübereinstimmungen zwischen dem
zweiten Index-Read und der Indexsequenz. Der Standardwert ist 1.
Zeichenfolge zur Angabe der UMI-Zyklen und zum Ausschluss von
Zyklen aus einem Read. Folgende Werte sind zulässig:
• N: Gibt die zu ignorierenden Zyklen an.
• Y: Gibt die Sequenzierungszyklen an.
• I: Gibt die Indexzyklen an.
• U: Gibt die zu trimmenden UMI-Zyklen an.
Die einzelnen Elemente werden mit Semikola getrennt. Im
Folgenden finden Sie Beispiele für OverrideCycles-Eingaben.
U8Y143;I8;I8;U8Y143
N10Y66;I6;N10Y66
66. Änderungen
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