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NextSeq 550Dx
illumina NextSeq 550Dx Handbücher
Anleitungen und Benutzerhandbücher für illumina NextSeq 550Dx. Wir haben
5
illumina NextSeq 550Dx Anleitungen zum kostenlosen PDF-Download zur Verfügung: Referenzhandbuch, Handbuch, Sicherheits- Und Compliancehandbuch
illumina NextSeq 550Dx Referenzhandbuch (79 Seiten)
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
| Dateigröße: 1.55 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
5
Kapitel 1 Überblick
7
Sequenzierungsfunktionen
7
Weitere Ressourcen
7
Gerätekomponenten
8
Reagenzien- und Pufferkammer
8
Überblick über das Reagenzien-Kit
10
Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien - Überblick
10
Lagerungsanforderungen für Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
10
Fließzelle - Überblick
11
Herausnehmbarer Behälter in Position
12
Pufferkartusche - Überblick
12
Bibliotheksverdünnungspuffer - Überblick
13
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Ausstattung
13
Verbrauchsmaterialien für die Sequenzierung
13
Verbrauchsmaterialien für Wartung und Fehlerbehebung
13
Ausstattung
14
Richtlinien für Wasser in Laborqualität
14
Kapitel 2 Nextseq 550Dx-Software
15
Nextseq 550Dx-Software - Überblick Local Run Manager - Überblick Benutzerkennwörter
15
Statussymbole
15
Symbole in der Navigationsleiste
16
Local Run Manager - Überblick
17
Anzeigen von Local Run Manager
17
Anzeige auf einem Netzwerkcomputer
18
Sequenzierung während der Analyse
18
Dashboard - Überblick
19
Ausblenden und Wiederherstellen von Läufen
21
Suchen nach Läufen und Proben
21
Bearbeiten eines Laufs
22
Anheften eines Laufs
22
Löschen eines Laufordners
22
Neuverknüpfen eines Laufordners
22
Benutzerkennwörter
23
Mein Konto
23
Ändern Ihres Kennworts
24
Kapitel 3 Erste Schritte
25
Starten des Geräts
25
Gerätemodusanzeigen
26
Anpassen der Systemeinstellungen
26
Ändern des Avatarbilds und des Kurznamens des Geräts
26
Festlegen der Tastaturoption und der Audio-Signale
26
Festlegen von Laufbeginn und Geräteleistungsdaten
27
Festlegen des Standardausgabeordners
27
Optionen für das Ausschalten und Neustarten des Geräts
28
Neustart IM Forschungsmodus
28
Neustart IM Diagnosemodus
28
Rückkehr zum Diagnosemodus aus dem Forschungsmodus
28
Ausschalten des Geräts
29
Beim Beenden Windows Aufrufen
29
Kapitel 4 Sequenzierung
30
Einleitung
30
Clusterbildung
30
Dauer eines Sequenzierungslaufs
30
Sequenzierungsworkflow
31
Erstellen eines Laufs mit der Local Run Manager-Software
31
Vorbereiten der Reagenzienkartusche
32
Vorbereiten der Fließzelle
32
Vorbereiten von Bibliotheken für die Sequenzierung
33
Laden der Bibliotheken in die Reagenzienkartusche
33
Konfigurieren eines Sequenzierungslaufs
33
Auswählen eines Laufs
33
Laden der Fließzelle
33
Leeren des Behälters für Verbrauchte Reagenzien
35
Einsetzen der Pufferkartusche
36
Laden der Reagenzienkartusche
36
Herausnehmen des Behälters für Gebrauchte Reagenzien in Position
37
Überprüfen des Selbsttests
38
Starten des Laufs
38
Überwachen des Lauffortschritts
39
Zyklen für Laufkennzahlen
39
Datenübertragung
40
Anzeigen von Lauf- und Probendaten
40
Registerkarte "Run Overview" (Laufübersicht)
40
Registerkarte "Samples and Results" (Proben und Ergebnisse)
41
Mögliche Laufstatus
42
Erneutes Einstellen der Analyse in die Warteschlange oder Stoppen der Analyse
43
Stoppen einer Local Run Manager-Analyse
43
Erneutes Einstellen der Analyse in die Warteschlange von der Ergebnisseite aus
43
Ändern des Speicherorts für den Ausgabe-Laufordner
44
Automatische Nachwaschung
44
Nach dem Waschlauf
44
Entladen von Verbrauchsmaterialien
44
Kapitel 5 Wartung
45
Einleitung
45
Durchführen eines Manuellen Waschlaufs
45
Vorbereiten einer Manuellen Nachwaschung
46
Vorbereiten eines Schnellwaschlaufs
47
Laden einer Gebrauchten Fließzelle und der Waschlaufkartuschen
47
Austausch des Luftfilters
48
Anhang A von Administratoren Durchzuführende Einstellungen und Aufgaben in Zusammenhang mit Local Run Manager
50
Einleitung
50
User Management (Benutzerverwaltung) Systemeinstellungen Moduleinstellungen Prüfpfade
50
Benutzerberechtigungen
51
Erstellen eines Neuen Benutzers
51
Zurücksetzen des Benutzerkennworts
52
Entsperren des Benutzerkennworts
52
Ändern von Benutzerberechtigungen
52
Löschen eines Benutzers
52
Systemeinstellungen
53
Festlegen von Systemsicherheitseinstellungen
53
Festlegen von Systemwartungseinstellungen
53
Festlegen der Einstellungen für Systemdienstkonten
54
Moduleinstellungen
54
Filtern von Prüfpfaden
55
Filtern nach einer Kategorie Betroffener Elemente
56
Exportieren von Prüfpfaden
56
Anhang B Fehlerbehebung
58
Einleitung
58
Durchführen einer Systemprüfung
59
Optik-Prüfung
59
Dateien für die Fehlerbehebung
60
Dateien für die Fehlerbehebung bei Sequenzierungsläufen
60
Beheben von Fehlern der Automatischen Prüfung
61
Tests für Sequenzierungsläufe
61
Behälter für Verbrauchte Reagenzien ist Voll
62
RAID-Fehlermeldung
62
Netzwerkspeicherfehler
63
Konfigurieren der Systemeinstellungen
63
Einrichten der Netzwerkkonfiguration
63
Anhang C Real-Time Analysis
65
Überblick über Real-Time Analysis
65
RTA2-Eingabedaten
65
RTA2-Ausgabedateien
65
Real-Time Analysis-Workflow
66
Matrizenbildung
66
Registrierung und Intensitätsextraktion
66
Korrektur der Phasierung
67
Cluster nach Filterung
68
Qualitätsbewertung
68
Anhang D Ausgabedateien und -Ordner
70
Sequenzierungsausgabedateien
70
Fließzellenplatten
70
Lane-Nummerierung
71
Kameranummerierung
72
Plattennummerierung
72
Ordnerstruktur der Ausgabedaten
73
Index
74
Technische Unterstützung
78
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illumina NextSeq 550Dx Referenzhandbuch (80 Seiten)
Forschungsmodus
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
| Dateigröße: 6.94 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
4
Kapitel 1 Überblick
6
Über dieses Handbuch
6
Einleitung
6
Funktionen für das Array-Scannen
6
Weitere Ressourcen
7
Gerätekomponenten
8
Reagenzien- und Pufferkammer
8
Statussymbole
9
Wiederverwendbarer Beadchip-Adapter - Überblick
10
Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien - Überblick
11
Beschriftungen zur Kit-Kompatibilität
11
Fließzelle - Überblick
12
Reagenzienkartusche - Überblick
13
Herausnehmbarer Behälter in Position
14
Pufferflasche - Überblick
14
Kapitel 2 Erste Schritte
16
Starten des Geräts
16
Anpassen der Systemeinstellungen
17
Ändern des Avatarbilds und des Kurznamens des Geräts
17
Festlegen der Tastaturoption und Audio-Signale
18
Festlegen von Laufkonfigurationsoptionen
18
Festlegen der Option zur Automatischen Entsorgung von Verbrauchsmaterialien
18
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte
18
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien für Sequenzierungsläufe
19
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien für die Gerätewartung
19
Richtlinien für Wasser in Laborqualität
19
Vom Benutzer Bereitzustellende Ausstattung
19
Kapitel 3 Sequenzierung
20
Einleitung
20
Clusterbildung
20
Dauer eines Sequenzierungslaufs
20
Anzahl der Zyklen in einem Read
21
Sequenzierungsworkflow
21
Vorbereiten der Reagenzienkartusche
21
Vorbereiten der Fließzelle
22
Vorbereiten von Bibliotheken für die Sequenzierung
22
Denaturieren und Verdünnen von Bibliotheken
22
Laden der Bibliotheken in die Reagenzienkartusche
23
Konfigurieren eines Sequenzierungslaufs
23
Anmelden bei Basespace
23
Laden der Fließzelle
23
Leeren des Behälters für Verbrauchte Reagenzien
25
Einsetzen der Pufferflasche
26
Laden der Reagenzienkartusche
26
Herausnehmen des Gebrauchten Behälters in Position
27
Festlegen von Laufparametern
28
Auswählen eines Verfügbaren Laufs (Basespace-Konfiguration)
28
Eingeben der Laufparameter (Eigenständige Konfiguration)
29
Überprüfen des Selbsttests
29
Starten des Laufs
30
Überwachen des Lauffortschritts
30
Zyklen für Laufkennzahlen
31
Datenübertragung
31
Automatische Nachwaschung
32
Nach dem Waschlauf
32
Kapitel 4 Scannen
34
Einleitung
34
Manifest- und Clusterdateien
34
Scan-Workflow
35
Herunterladen des DMAP-Ordners
35
Zugriff auf den DMAP-Ordner nach Konto
35
Zugriff auf den DMAP-Ordner nach Beadchip
36
Einsetzen des Beadchips in den Adapter
36
Konfigurieren eines Scan-Vorgangs
37
Entladen der Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
37
Starten des Scan-Vorgangs
39
Überwachen des Scan-Fortschritts
39
Kapitel 5 Wartung
42
Einleitung
42
Präventive Wartung
42
Durchführen eines Manuellen Waschlaufs
42
Vorbereiten eines Manuellen Nachwaschlaufs
43
Vorbereiten eines Schnellwaschlaufs
44
Laden einer Gebrauchten Fließzelle und der Waschlaufkartuschen
44
Austausch des Luftfilters
45
Software-Updates
46
Automatisches Software-Update
47
Optionen für das Ausschalten und Neustarten des Geräts
48
Neustart IM Diagnosemodus
48
Ausschalten des Geräts
48
Exit to Windows (Beim Beenden Windows Aufrufen)
48
Anhang A Fehlerbehebung
50
Einleitung
50
Dateien für die Fehlerbehebung
50
Dateien für die Fehlerbehebung bei Array-Scan-Vorgängen
51
Beheben von Fehlern der Automatischen Prüfung
51
Tests für Sequenzierungsläufe
51
Tests für Array-Scans
53
Behälter für Verbrauchte Reagenzien ist Voll
53
Workflow für die Rehybridisierung
54
Zeitpunkte für das Beenden eines Laufs für die Rehybridisierung
54
Erforderliche Verbrauchsmaterialien
54
Konfigurieren eines Neuen Laufs auf der Registerkarte "Basespace Prep" (Basespace-Vorbereitung)
55
Konfigurieren eines Laufs auf dem Gerät
55
Beadchip- und Scan-Fehler
56
Software kann den Beadchip-Barcode nicht Einlesen
56
Fehlerhafter Beadchip-Scan-Vorgang
56
Erneut Scannen oder einen Neuen Scan-Vorgang Starten
57
Ersetzen von Manifest- und Clusterdateien
57
Anwendungsspezifische Rezepturen und Rezepturordner
57
RAID-Fehlermeldung
58
Konfigurieren der Systemeinstellungen
58
Einrichten der Netzwerkkonfiguration
58
Einrichten der Analysekonfiguration
59
Anhang B Echtzeitanalyse
62
Überblick über die Echtzeitanalyse Echtzeitanalyse-Workflow
62
Fehlerbehandlung
63
Matrizenbildung
63
Registrierung und Intensitätsextraktion
63
Korrektur der Phasierung
64
Cluster nach Filterung
65
Qualitätsbewertung
66
Anhang C Ausgabedateien und -Ordner
68
Sequenzierungsausgabedateien
68
Fließzellenplatten
68
Lane-Nummerierung
69
Kameranummerierung
70
Plattennummerierung
70
Ordnerstruktur der Sequenzierungsausgabedaten
71
Scan-Ausgabedateien
72
Ordnerstruktur der Ausgegebenen Scan-Daten
72
Index
74
Technische Unterstützung
78
illumina NextSeq 550Dx Referenzhandbuch (78 Seiten)
Marke:
illumina
| Kategorie:
Analyseinstrumente
| Dateigröße: 1.48 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
4
Kapitel 1 Überblick
6
Über dieses Handbuch
6
Einleitung
6
Weitere Ressourcen
6
Gerätekomponenten
7
Reagenzien- und Pufferkammer
8
Statussymbole
9
Wiederverwendbarer Beadchip-Adapter - Überblick
10
Überblick über das Reagenzien-Kit
10
Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien - Überblick
10
Kennzeichnung zur Kit-Kompatibilität
11
Fließzelle - Überblick
11
Reagenzienkartusche - Überblick
12
Herausnehmbarer Behälter in Position
13
Pufferkartusche - Überblick
13
Kapitel 2 Erste Schritte
14
Starten des Geräts
14
Gerätemodusanzeigen
15
Anpassen der Systemeinstellungen
15
Ändern des Avatarbilds und des Kurznamens des Geräts
15
Festlegen der Tastaturoption und der Audio-Signale
15
Festlegen von Laufkonfigurationsoptionen
16
Festlegen der Option zur Automatischen Entsorgung von Verbrauchsmaterialien
16
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Ausstattung
16
Verbrauchsmaterialien für die Sequenzierung
17
Verbrauchsmaterialien für Wartung und Fehlerbehebung
17
Ausstattung
17
Kapitel 3 Sequenzierung
18
Einleitung
18
Clusterbildung
18
Dauer eines Sequenzierungslaufs
18
Sequenzierungsworkflow
19
Vorbereiten der Reagenzienkartusche
19
Vorbereiten der Fließzelle
20
Vorbereiten von Bibliotheken für die Sequenzierung
20
Denaturieren und Verdünnen von Bibliotheken
21
Laden der Bibliotheken in die Reagenzienkartusche
21
Konfigurieren eines Sequenzierungslaufs
21
Anmelden bei Basespace
21
Laden der Fließzelle
21
Leeren des Behälters für Verbrauchte Reagenzien
23
Einsetzen der Pufferkartusche
24
Laden der Reagenzienkartusche
24
Festlegen von Laufparametern
26
Auswählen eines Verfügbaren Laufs (Basespace-Konfiguration)
26
Eingeben der Laufparameter (Eigenständige Konfiguration)
27
Überprüfen des Selbsttests
28
Starten des Laufs
28
Überwachen des Lauffortschritts
28
Zyklen für Laufkennzahlen
28
Datenübertragung
29
Automatische Nachwaschung
30
Nach dem Waschlauf
30
Kapitel 4 Scannen
32
Einleitung
32
Manifest- und Clusterdateien
32
Scan-Workflow
33
Herunterladen des DMAP-Ordners
33
Zugriff auf den DMAP-Ordner nach Konto
33
Zugriff auf den DMAP-Ordner nach Beadchip
34
Einsetzen des Beadchips in den Adapter
34
Konfigurieren eines Scan-Vorgangs
35
Entladen der Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
35
Starten des Scan-Vorgangs
37
Überwachen des Scan-Fortschritts
37
Kapitel 5 Wartung
40
Einleitung
40
Präventive Wartung
40
Durchführen eines Manuellen Waschlaufs
40
Vorbereiten einer Manuellen Nachwaschung
41
Vorbereiten eines Schnellwaschlaufs
42
Laden einer Gebrauchten Fließzelle und der Waschlaufkartuschen
42
Austausch des Luftfilters
43
Software-Updates
44
Automatisches Software-Update
45
Optionen für das Ausschalten und Neustarten des Geräts
46
Neustart IM Diagnosemodus
46
Ausschalten des Geräts
46
Beenden und Windows Aufrufen
47
Anhang A Fehlerbehebung
48
Einleitung
48
Dateien für die Fehlerbehebung
48
Dateien für die Fehlerbehebung bei Array-Scan-Vorgängen
49
Beheben von Fehlern der Automatischen Prüfung
49
Tests für Sequenzierungsläufe
49
Tests für Array-Scans
51
Behälter für Verbrauchte Reagenzien ist Voll
51
Workflow für die Rehybridisierung
52
Zeitpunkte für das Beenden eines Laufs für die Rehybridisierung
52
Erforderliche Verbrauchsmaterialien
52
Konfigurieren eines Neuen Laufs auf der Registerkarte "Basespace Prep" (Basespace-Vorbereitung)
53
Konfigurieren eines Laufs auf dem Gerät
53
Beadchip- und Scan-Fehler
54
Software kann den Beadchip-Barcode nicht Einlesen
54
Fehlerhafter Beadchip-Scan-Vorgang
54
Ersetzen von Manifest- und Clusterdateien
55
Anwendungsspezifische Rezepte und Rezeptordner
55
RAID-Fehlermeldung
56
Konfigurieren der Systemeinstellungen
56
Einrichten der Netzwerkkonfiguration
56
Einrichten der Analysekonfiguration
57
Anhang B Real-Time Analysis
60
Überblick über Real-Time Analysis
60
RTA2-Eingabedaten
60
RTA2-Ausgabedateien
60
Real-Time Analysis-Workflow
61
Matrizenbildung
61
Registrierung und Intensitätsextraktion
61
Korrektur der Phasierung
62
Cluster nach Filterung
63
Qualitätsbewertung
63
Anhang C Ausgabedateien und -Ordner
66
Sequenzierungsausgabedateien
66
Fließzellenplatten
66
Lane-Nummerierung
67
Kameranummerierung
68
Plattennummerierung
68
Ordnerstruktur der Ausgabedaten
69
Scan-Ausgabedateien
70
Ordnerstruktur der Ausgegebenen Scan-Daten
70
Index
72
Technische Unterstützung
76
Dokument-Nr. 1000000041922 V03 DEU
78
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illumina NextSeq 550Dx Handbuch (19 Seiten)
zur Standortvorbereitung für das Gerät
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
| Dateigröße: 0.44 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
1
Einleitung
3
Sicherheitshinweise
3
Weitere Ressourcen
3
Abmessungen und Inhalt der Transportkiste
4
Lieferung und Installation
4
Gerätemaße
5
Laboranforderungen
5
Labortisch-Richtlinien
6
Laboreinrichtung für PCR-Verfahren
6
Vor-PCR- und Nach-PCR-Bereiche
6
Zuweisen von Geräten und Materialien
7
Lagerungsanforderungen für Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
7
Elektrische Anforderungen
7
Unterbrechungsfreie Stromversorgung
8
Umgebungsanforderungen
8
Netzwerk- und Computersicherheit
9
Netzwerkverbindungen
10
Netzwerkerwägungen
10
Netzwerkunterstützung
12
Interne Verbindungen
12
Ausgehende Verbindungen
13
Laufwerkszuordnung
14
Windows-Updates
14
Software von Drittanbietern
14
Benutzerverhalten
14
Verbrauchsmaterialien für die Sequenzierung
15
Verbrauchsmaterialien für Wartung und Fehlerbehebung
15
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte
15
Richtlinien für Wasser in Laborqualität
16
Ausstattung
16
Versionshistorie
17
Technische Unterstützung
18
illumina NextSeq 550Dx Sicherheits- Und Compliancehandbuch (5 Seiten)
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
| Dateigröße: 0.25 MB
Inhaltsverzeichnis
Produkt-Compliance und Regulatorische Vorschriften
3
Abgeschirmte Kabel
3
Hinweise Hinsichtlich der Elektromagnetischen Verträglichkeit
4
Urheberrecht und Marken
5
Kontaktinformationen
5
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