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Anleitungen und Benutzerhandbücher für illumina NextSeq 2000. Wir haben
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illumina NextSeq 2000 Anleitungen zum kostenlosen PDF-Download zur Verfügung: Handbuch, Handbuch Zur Standortvorbereitung, Sicherheits- Und Compliancehandbuch
illumina NextSeq 2000 Handbuch (129 Seiten)
Sequenziersystem
Marke:
illumina
| Kategorie:
Studio & Recording
| Dateigröße: 1 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
7
Systemüberblick
9
Weitere Ressourcen
10
Gerätehardware
12
Stromanschluss und andere Anschlüsse
12
Integrierte Software
14
Informationen zum System
15
Benachrichtigungen und Warnungen
15
Minimieren der Steuerungssoftware
15
Prozessmanagement
15
Status of Secondary Analysis (Status der Sekundäranalyse)
16
Status of Output Folder (Status des Ausgabeordners)
16
Status of Cloud (Status der Cloud, Basespace Sequence Hub)
16
Beheben von Statusfehlern
16
Diagramm zum Sequenzierungsprotokoll
17
Funktionsweise der Sequenzierung
17
Clusterbildung
17
Sequenzierung
18
Systemkonfiguration
20
Anforderungen in Bezug auf Benutzerkonten
20
Hinzufügen eines Neuen Benutzers
21
Zurücksetzen des Kennworts
22
Konfigurieren von Basespace Sequence Hub und Proactive Support
23
Festlegen des Standardspeicherorts für den Ausgabeordner
24
Angeben eines Externen Laufwerks als Ausgabeordner
24
Festlegen eines Netzwerklaufwerks als Standardausgabeordner
25
Anweisungen zum Mounten von SMB/CIFS
25
Anweisungen zum Mounten von NFS
26
Festlegen des Festen Netzwerklaufwerks als Standardausgabeordner
27
Importieren Anwendungsspezifischer Referenzgenome
28
Importieren von Dateien für das Grundrauschen
28
Importieren von Dateien für das Grundrauschen über die Benutzeroberfläche
29
Konfigurieren des Laufmodus
30
Cloud- oder Hybrid-Modus
30
Local- und Standalone-Modus
30
Geräteanpassung
31
Konfigurieren von Software-Updates
32
Ändern der LCD-Helligkeit
32
Einrichten eines Proxy-Servers
32
Verbrauchsmaterialien und Ausstattung
34
Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
34
Fließzelle
35
Unterstützte Anzahl von Zyklen
36
Zusätzliche Verbrauchsmaterialien
37
Zusätzliche Ausstattung
40
Protokoll
41
Erwägungen zur Sequenzierung
41
Ladevolumen und -Konzentrationen
41
Planen eines Sequenzierungslaufs in Basespace Sequence Hub
43
Konfigurieren eines Laufs
43
Konfigurieren der Sekundäranalyse
45
Auftauen der IM Folienbeutel Verpackten Kartusche und der Fließzelle
51
Auftauen der Kartusche in einem Geregelten Wasserbad
52
Auftauen der Kartusche in einem Kühlschrank
53
Auftauen der Kartusche bei Raumtemperatur
53
Vorbereiten von Fließzelle und Kartusche
53
Verdünnen von Bibliotheken
54
Verdünnen der 2-Nm-Bibliothek auf Ladekonzentration
55
Hinzufügen einer Phix-Kontrolle (Optional)
56
Laden von Verbrauchsmaterialien in die Kartusche
56
Vorbereiten der Kartusche
56
Laden der Fließzelle
57
Laden der Bibliotheken
58
Starten eines Sequenzierungslaufs
58
Starten eines Cloud- oder Hybrid-Laufs
59
Starten eines Lokalen Laufs
60
Initiieren eines Eigenständigen Laufs
62
Laden der Verbrauchsmaterialien in das Gerät
63
Selbsttests
64
Überwachen des Lauffortschritts
65
Entladen von Verbrauchsmaterialien
65
Recyceln der Kartuschenkomponenten
66
Sequenzierungsausgabe
72
Überblick über Real-Time Analysis
72
RTA3-Eingabedaten
72
RTA3-Ausgabedaten
72
Fehlerbehandlung
73
Fließzellenplatten
73
Plattenbenennung
74
Real-Time Analysis-Workflow
75
Registrierung
75
Cluster nach Filterung
77
Qualitätsbewertung und Berichterstellung
78
Sequenzierungsausgabedateien
79
Ausgabedateien der DRAGEN-Sekundäranalyse
80
Bericht zur Demultiplexing-Statistik
86
Bericht zur Index-Hopping-Zählung
87
Ausgabeordnerstruktur der DRAGEN-Sekundäranalyse
90
Wartung
93
Freimachen von Speicherplatz auf der Festplatte
93
Software-Updates
94
Installieren eines Automatischen Software-Updates
94
Installieren eines Manuellen Software-Updates
95
Workflow- und Lizenz-Updates für DRAGEN
96
Verlängern der DRAGEN-Lizenz Online
96
Verlängern der DRAGEN-Lizenz Offline
96
Installieren von DRAGEN-Workflows Offline
97
Austauschen des Luftfilters
98
Fehlerbehebung
100
Beheben von Fehlermeldungen
100
Erneutes Lagern von Verbrauchsmaterialien
101
Abbrechen eines Laufs
101
Erneutes Stellen eines Laufs in die Warteschlange
102
Aus- und Wiedereinschalten des Geräts
103
Durchführen einer Systemprüfung
104
Durchführung einer Systemprüfung
104
Wiederherstellen der Werkseinstellungen
104
Speichern eines Systemimages
105
Wiederherstellen eines Gespeicherten Images
105
Quellen und Verweise
106
Einstellungen für Probenblätter der Version 2
106
BCL-Konvertierung - Anforderungen
108
Einstellungen für DRAGEN-Probenblätter
110
Anforderungen für die DRAGEN Germline-Pipeline
111
Anforderungen für die DRAGEN Enrichment-Pipeline
113
Anforderungen für die DRAGEN Single Cell RNA-Pipeline
116
Dunkelzyklus-Sequenzierung
121
Bearbeiten der Rezepturdatei
121
Verknüpfen der Rezeptur mit einem Lauf
122
Index
123
Technische Unterstützung
127
Dokument-Nr. 1000000109376 V05 DEU
129
illumina NextSeq 2000 Handbuch (82 Seiten)
Sequenziersystem
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
| Dateigröße: 1 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
4
Systemüberblick
6
Weitere Ressourcen
7
Gerätehardware
7
Stromanschluss und andere Anschlüsse
8
Integrierte Software
10
Informationen zum System
10
Benachrichtigungen und Warnungen
10
Minimieren der Steuerungssoftware
10
Process Management (Prozessmanagement)
11
Status of Secondary Analysis (Status der Sekundäranalyse)
11
Status of Output Folder (Status des Ausgabeordners)
11
Status of Cloud (Status der Cloud, Basespace Sequence Hub)
11
Beheben von Statusfehlern
11
Diagramm zum Sequenzierungsprotokoll
12
Funktionsweise der Sequenzierung
12
Clusterbildung
12
Sequenzierung
13
Systemkonfiguration
15
Anforderungen in Bezug auf Benutzerkonten
15
Konfigurieren von Basespace Sequence Hub und Proactive Support
16
Festlegen des Standardspeicherorts für den Ausgabeordner
17
Angeben eines Externen Laufwerks als Ausgabeordner
17
Festlegen eines Netzwerklaufwerks als Standardausgabeordner
17
Anweisungen zum Mounten von SMB/CIFS
17
Anweisungen zum Mounten von NFS
19
Festlegen des Festen Netzwerklaufwerks als Standardausgabeordner
19
Importieren Anwendungsspezifischer Referenzgenome
19
Konfigurieren des Laufmodus
20
Cloud- oder Hybrid-Modus
20
Local- und Standalone-Modus
20
Erwägungen Hinsichtlich Probenblättern für den Local- und den Standalone-Modus
21
Geräteanpassung
21
Festlegen der Voreinstellung für die Automatische Entleerung von Reagenzien
21
Konfigurieren von Software-Updates
22
Verbrauchsmaterialien und Ausstattung
23
Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
23
Fließzelle
23
Unterstützte Anzahl von Zyklen
25
Zusätzliche Verbrauchsmaterialien
26
Verbrauchsmaterialien für die Sequenzierung
26
Verbrauchsmaterialien für die Wartung
27
Zusätzliche Ausstattung
28
Protokoll
29
Erwägungen zur Sequenzierung
29
Ladevolumen und -Konzentrationen
29
Anzahl der Zyklen in einem Read
30
Planen eines Sequenzierungslaufs in Basespace Sequence Hub
30
Konfigurieren eines Laufs
30
Konfigurieren der Sekundäranalyse
32
Auftauen der IM Folienbeutel Verpackten Kartusche
34
Auftauen in einem Geregelten Wasserbad
35
Auftauen in einem Kühlschrank
36
Auftauen bei Raumtemperatur
36
Vorbereiten der Fließzelle und der Bibliotheken
36
Vorbereiten von Fließzelle und Kartusche
37
Verdünnen der Bibliothek auf 2 Nm
37
Verdünnen der 2-Nm-Bibliothek auf Ladekonzentration
37
Hinzufügen einer Phix-Kontrolle (Optional)
38
Laden von Verbrauchsmaterialien in die Kartusche
39
Vorbereiten der Kartusche
39
Laden der Fließzelle
39
Laden der Bibliotheken
40
Starten eines Sequenzierungslaufs
41
Starten eines Cloud- oder Hybrid-Laufs
41
Starten eines Lokalen Laufs
42
Initiieren eines Eigenständigen Laufs
43
Laden der Verbrauchsmaterialien in das Gerät
44
Selbsttests
45
Überwachen des Lauffortschritts
46
Entladen von Verbrauchsmaterialien
46
Sequenzierungsausgabe
48
Überblick über Real-Time Analysis
48
RTA3-Eingabedaten
48
RTA3-Ausgabedaten
48
Fehlerbehandlung
48
Fließzellenplatten
49
Plattenbenennung
49
Real-Time Analysis-Workflow
50
Registrierung
50
Korrektur der Phasierung
50
Cluster nach Filterung
52
Qualitätsbewertung und Berichterstellung
53
Sequenzierungsausgabedateien
54
Ausgabedateien der DRAGEN-Sekundäranalyse
54
Bericht zur Demultiplexing-Statistik
57
Bericht zur Index-Hopping-Zählung
58
Bericht zu den Häufigsten Unbekannten Barcodes
59
Ausgabeordnerstruktur der DRAGEN-Sekundäranalyse
59
Wartung
61
Freimachen von Speicherplatz auf der Festplatte
61
Software-Updates
61
Installieren eines Automatischen Software-Updates
62
Installieren eines Manuellen Software-Updates
62
Pipeline- und Lizenz-Updates für DRAGEN
63
Verlängern der DRAGEN-Lizenz Online
63
Verlängern der DRAGEN-Lizenz Offline
63
Installieren von Pipeline-Updates
63
Austauschen des Luftfilters
64
Fehlerbehebung
66
Beheben von Fehlermeldungen
66
Erneutes Lagern von Verbrauchsmaterialien
66
Abbrechen eines Laufs
67
Erneutes Stellen eines Laufs in die Warteschlange
67
Aus- und Wiedereinschalten des Geräts
68
Wiederherstellen der Werkseinstellungen
69
Speichern eines Systemimages
69
Wiederherstellen eines Gespeicherten Images
70
Quellen und Verweise
71
Einstellungen für Probenblätter der Version 2
71
BCL-Konvertierung - Anforderungen
72
Einstellungen für DRAGEN-Probenblätter
73
Anforderungen für die DRAGEN Germline-Pipeline
74
Anforderungen für die DRAGEN RNA-Pipeline
75
Anforderungen für die DRAGEN Enrichment-Pipeline
76
Index
77
Technische Unterstützung
81
Dokument-Nr. 1000000109376 V01 DEU
82
illumina NextSeq 2000 Handbuch (70 Seiten)
Sequenziersystem
Marke:
illumina
| Kategorie:
Datenlogger
| Dateigröße: 1 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
3
Systemüberblick
5
Weitere Ressourcen
6
Gerätehardware
6
Stromanschluss und andere Anschlüsse
7
Integrierte Software
9
Informationen zum System
9
Benachrichtigungen und Warnungen
9
Minimieren der Steuerungssoftware
9
Process Management (Prozessmanagement)
10
Status of Secondary Analysis (Status der Sekundäranalyse)
10
Status of Output Folder (Status des Ausgabeordners)
10
Status of Cloud (Status der Cloud, Basespace Sequence Hub)
10
Beheben von Statusfehlern
10
Diagramm zum Sequenzierungsprotokoll
11
Funktionsweise der Sequenzierung
11
Clusterbildung
11
Sequenzierung
12
Systemkonfiguration
13
Anforderungen in Bezug auf Benutzerkonten
13
Festlegen des Standardspeicherorts für den Ausgabeordner
13
Angeben eines Externen Laufwerks als Ausgabeordner
14
Festlegen eines Netzwerklaufwerks als Standardausgabeordner
14
Erstellen einer Sicheren Datei mit Anmeldeinformationen
14
Zuordnen des Festen Netzwerklaufwerks
15
Festlegen des Festen Netzwerklaufwerks als Standardausgabeordner
15
Konfigurieren von Basespace Sequence Hub
15
Konfigurieren des Laufmodus
17
Cloud- oder Hybrid-Modus
17
Local- und Standalone-Modus
17
Erwägungen Hinsichtlich Probenblättern für den Local- und Standalone-Modus
17
Verbrauchsmaterialien und Ausstattung
18
Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
18
Fließzelle
18
Unterstützte Anzahl von Zyklen
20
Zusätzliche Verbrauchsmaterialien
21
Verbrauchsmaterialien für die Sequenzierung
21
Verbrauchsmaterialien für die Wartung
22
Zusätzliche Ausstattung
22
Protokoll
24
Erwägungen zur Sequenzierung
24
Ladevolumen und -Konzentrationen
24
Anzahl der Zyklen in einem Read
24
Planen eines Sequenzierungslaufs in Basespace Sequence Hub
25
Konfigurieren eines Laufs
25
Konfigurieren der Sekundäranalyse
26
Auftauen der IM Folienbeutel Verpackten Kartusche
28
Auftauen in einem Geregelten Wasserbad
29
Auftauen bei Raumtemperatur
29
Vorbereiten der Fließzelle und der Bibliotheken
30
Vorbereiten von Fließzelle und Kartusche
30
Verdünnen der Bibliothek auf 2 Nm
30
Verdünnen der 2-Nm-Bibliothek auf Ladekonzentration
31
Hinzufügen einer Phix-Kontrolle (Optional)
32
Laden von Verbrauchsmaterialien in die Kartusche
32
Vorbereiten der Kartusche
32
Laden der Fließzelle
32
Laden der Bibliotheken
33
Starten eines Sequenzierungslaufs
34
Starten eines Cloud- oder Hybrid-Laufs
34
Starten eines Lokalen Laufs
35
Initiieren eines Eigenständigen Laufs
36
Laden der Verbrauchsmaterialien in das Gerät
37
Überprüfen der Selbsttests
38
Überwachen des Lauffortschritts
38
Entladen von Verbrauchsmaterialien
39
Sequenzierungausgabe
40
Überblick über die Echtzeitanalyse
40
Fließzellenplatten
41
Plattenbenennung
41
Echtzeitanalyse-Workflow
42
Registrierung
42
Korrektur der Phasierung
42
Cluster nach Filterung
44
Qualitätsbewertung und Berichterstellung
45
Sequenzierungausgabe
45
Sequenzierungsausgabedateien
45
DRAGEN-Sekundäranalyse
46
Demultiplexing-Statistikbericht
48
Trim-Metrikbericht
49
Bericht zu den Häufigsten Unbekannten Barcodes
50
Wartung
52
Freimachen von Speicherplatz auf der Festplatte
52
Software-Updates
52
Installieren eines Manuellen Software-Updates
53
Austausch des Luftfilters
53
Fehlerbehebung
55
Beheben von Fehlermeldungen
55
Erneutes Lagern von Verbrauchsmaterialien
55
Abbrechen eines Laufs
56
Aus- und Wiedereinschalten des Geräts
56
Wiederherstellen der Werkseinstellungen
57
Speichern eines Systemimages
58
Wiederherstellen eines Gespeicherten Images
58
Quellen und Verweise
59
Einstellungen für Probenblätter der Version 2
59
BCL-Konvertierung - Anforderungen
60
Einstellungen für DRAGEN-Probenblätter
61
Anforderungen für die DRAGEN-Keimbahn-Pipeline
62
Anforderungen für die DRAGEN-RNA-Pipeline
62
Anforderungen für die DRAGEN-Anreicherungs-Pipeline
63
Index
65
Technische Unterstützung
69
Dokument-Nr. 1000000109376 V00 DEU
70
illumina NextSeq 2000 Handbuch Zur Standortvorbereitung (27 Seiten)
Sequenziersysteme
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
Inhaltsverzeichnis
Versionshistorie
3
Inhaltsverzeichnis
4
Einleitung
6
Sicherheitshinweise
6
Weitere Ressourcen
6
Lieferung und Installation
7
Abmessungen und Inhalt der Transportkiste
8
Laboranforderungen
8
Gerätemaße
9
Standortanforderungen
9
Labortisch-Richtlinien
10
Richtlinien Hinsichtlich Erschütterungen
10
Laboreinrichtung für PCR-Verfahren
11
Vor-PCR- und Nach-PCR-Bereiche
11
Zuweisen von Geräten und Materialien
11
Lagerungsanforderungen für Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
11
Elektrische Anforderungen
12
Leistungsangaben
12
Kupplungen
12
Schutzerde
12
Netzkabel
12
Sicherungen
13
Unterbrechungsfreie Stromversorgung
13
Umgebungsanforderungen
14
Wärmeabgabe
14
Lärmemission
15
Netzwerkerwägungen
15
Netzwerkverbindungen
15
Netzwerkunterstützung
16
Verbindungen des Steuerungscomputers
17
Interne Verbindungen
17
Ausgehende Verbindungen
18
Betriebssystemkonfigurationen
19
Services
20
Mounten von Netzwerklaufwerken
20
Software von Drittanbietern
20
Benutzerverhalten
20
Datenausgabe und -Speicherung
21
Speicheranforderungen für Basespace Sequence Hub
21
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte
21
Verbrauchsmaterialien für die Sequenzierung
21
Verbrauchsmaterialien für die Wartung
23
Ausstattung
23
Technische Unterstützung
24
illumina NextSeq 2000 Handbuch Zur Standortvorbereitung (18 Seiten)
Sequenziersystem
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
1
Einleitung
3
Umgebungsbedingungen
3
Sicherheitshinweise
3
Weitere Ressourcen
3
Maße und Inhalt der Transportkiste
4
Lieferung und Installation
4
Laboranforderungen
4
Gerätemaße
5
Labortisch-Richtlinien
6
Laboreinrichtung für PCR-Verfahren
6
Vor-PCR- und Nach-PCR-Bereiche
7
Zuweisen von Geräten und Materialien
7
Lagerungsanforderungen für Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
7
Elektrische Anforderungen
7
Unterbrechungsfreie Stromversorgung
8
Umgebungsanforderungen
9
Netzwerkerwägungen
9
Netzwerkverbindungen
10
Netzwerkunterstützung
10
Verbindungen des Steuerungscomputers
11
Interne Verbindungen
11
Ausgehende Verbindungen
11
Mounten von Netzwerklaufwerken
13
Software von Drittanbietern
13
Benutzerverhalten
13
Speicheranforderungen für Basespace Sequence Hub
14
Verbrauchsmaterialien für die Sequenzierung
14
Datenausgabe und -Speicherung
14
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte
14
Verbrauchsmaterialien für die Wartung
15
Technische Unterstützung
16
illumina NextSeq 2000 Sicherheits- Und Compliancehandbuch (11 Seiten)
Sequenziersysteme
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
Inhaltsverzeichnis
Sicherheitserwägungen und Kennzeichnungen
3
Allgemeine Sicherheitshinweise
3
Laser-Sicherheitshinweis
3
Hinweise zur Elektrischen Sicherheit
4
Warnung Bezüglich Heißer Oberfläche
5
Sicherheitshinweis Bezüglich Schwerer Gegenstände
5
Sicherheitshinweis Bezüglich Mechanischer Teile
5
Auspacken, Installieren und Transportieren
5
Umgebungsanforderungen
5
Produkt-Compliance und Regulatorische Vorschriften
6
Vereinfachte Konformitätserklärung
6
Beschränkung der Verwendung Bestimmter Gefährlicher Stoffe (Rohs)
7
Exposition von Personen Gegenüber Hochfrequenzenergie
7
FCC-Compliance
7
Hinweise Hinsichtlich der Elektromagnetischen Verträglichkeit
8
Vereinigte Arabische Emirate - Compliance
8
Integrierter Compute-Server in Taiwan - Compliance
9
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