Fließzellenplatten; Plattenbenennung - illumina NextSeq 2000 Handbuch

NextSeq 2000-Sequenziersystem Handbuch
Wenn die Verarbeitung abgeschlossen ist, werden die folgenden Protokolldateien an das endgültige
Ausgabeziel übertragen:
info_00000.log enthält eine Zusammenfassung wichtiger Laufereignisse.
error_00000.log protokolliert während des Laufs aufgetretene Fehler.
warning_00000.log protokolliert während des Laufs aufgetretene Warnungen.
Fließzellenplatten
Platten sind kleine Bildgebungsbereiche auf der Fließzelle. Die Kamera nimmt ein Bild je Platte auf.
Die NextSeq 1000/2000 P2-Fließzelle enthält 132 Platten.
Tabelle 5 Fließzellenplatten
Fließzellenkomponente
Lanes
Oberflächen
Bildstreifen pro Lane
Platten je Bildstreifen
Gesamtanzahl
generierter Platten

Plattenbenennung

Bei dem Plattennamen handelt es sich um eine vierstellige Zahl, die die Plattenposition der Fließzelle
darstellt. Beispielsweise gibt der Plattenname 1205 Folgendes an: obere Oberfläche, Bildstreifen 2,
Platte 05.
Die erste Ziffer gibt die Oberfläche an: 1 für die Oberseite und 2 für die Unterseite.
Die zweite Ziffer gibt die Bildstreifennummer an: 1, 2, 3, 4, 5 oder 6.
Die letzten beiden Ziffern geben die Plattennummer an. Bei den Bildstreifen 1 bis 4 beginnt die
Nummerierung bei 01 am Auslassende der Fließzelle und reicht bis 14 am Einlassende. Bei den
Bildstreifen 5 bis 6 beginnt die Nummerierung bei 01 am Einlassende und reicht bis 11 am Auslassende.
Dokument-Nr. 1000000109376 v01 DEU
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in Diagnoseverfahren.
NextSeq 1000/2000
P2-Fließzelle
1
2
6
11
132
Beschreibung
Eine Lane ist ein physischer Kanal mit
Einlass- und Auslassöffnungen.
Zwei Oberflächen der P2-Fließzellen werden
aufgenommen: die obere und die untere. Die
obere Oberfläche einer Platte wird zuerst
abgebildet.
Ein Bildstreifen ist eine Spalte in einer
Fließzellen-Lane.
Eine Platte ist ein Teil eines Bildstreifens und
stellt einen abgebildeten Bereich auf der
Fließzelle dar.
Lanes × Oberflächen × Bildstreifen × Platten
je Bildstreifen ergibt die Gesamtanzahl an
Platten.
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