Rta-Ordner Und -Dateien; Fließzellenplatten - illumina MiSeq Handbuch

RTA-Ordner und -Dateien

In der folgenden Tabelle werden die Ordner und Dateien beschrieben, die während der
Primäranalyse von der Echtzeitanalyse (RTA) generiert werden. Viele dieser Dateien
werden von der MiSeq Reporter-Software für die Sekundäranalyse verwendet.
Schlüsseldatei
RTAComplete.txt
SampleSheet.csv
RunInfo.xml
*.bcl-Dateien
*.stats-Dateien
*.filter-Dateien
*.txt
*.cif-Dateien
*.locs-Dateien
*.jpg-Dateien
Fließzellenplatten
Während des Sequenzierungslaufs wird die einzelne Lane der Fließzelle in kleinen
Bildgebungsbereichen aufgenommen, die als Platten bezeichnet werden. Alle MiSeq-
Fließzellen haben eine einzelne Lane, aber die Anzahl der Platten ist je nach Typ der
verwendeten Fließzelle unterschiedlich.
Fließzelle
Standard-Fließzelle
PGS-Fließzelle
Standard-Fließzelle
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Unterordner Beschreibung
Stammordner Eine Markerdatei, die generiert wird, wenn die Base-
Call-Analyse abgeschlossen ist. Das Vorhandensein
dieser Datei löst den Start der Sekundäranalyse aus.
Stammordner Diese Datei wird vor dem Lauf gelesen und in den
Laufordner kopiert und später für die Sekundäranalyse
verwendet.
Stammordner Gibt die Grenzen der Reads (einschließlich Index-Reads)
und die für den Lauf ausgewählte Qualitätstabelle an.
Data\ Jede *.bcl-Datei enthält die RTA-Base-Calling- und RTA-
Intensities\BaseCalls\ Base-Qualitätsbewertungs-Ergebnisse für einen Zyklus
L001\CX.X und eine Platte.
Data\ *.stats-Dateien enthalten die Base-Calling-Statistik der
Intensities\BaseCalls\ RTA für einen bestimmten Zyklus/Platte.
L001\CX.X
Data\ *.filter-Dateien enthalten Filterergebnisse pro Platte.
Intensities\BaseCalls
Data\RTALogs Protokolldateien aus der Primäranalyse.
Data\ Jede binäre *.cif-Datei enthält die RTA-Bildanalyse-
Intensities\L001\ Ergebnisse für einen Zyklus und eine Platte. Weitere
CX.X Informationen finden Sie unter
Plattennummerierung auf Seite
Data\ Enthalten Berichte zu den Cluster-Koordinaten. Jede
Intensities\BaseCalls\ *.locs-Datei stellt eine Platte dar.
L001
Thumbnail_Images\ Miniaturbilder, die für jeden Zyklus und jede Base
L001\CX.X generiert werden und zur Fehlerbehebung bei einem
Lauf verwendet werden können. Diese Dateien werden
für die Bildanalyse verwendet. Sie werden nicht in den
Analyseordner kopiert. Informationen zu den
Bilddateinamen finden Sie unter
Plattennummerierung auf Seite
MiSeq-
Platten
Reagenzien-Kit
MiSeq-Reagenzien- 19 Platten Ober- und
Kits, v3
MiSeq-Reagenzien- 19 Platten Ober- und
Kit v3-PGS
MiSeq-Reagenzien- 14 Platten Ober- und
Kits, v2
Fließzellen-
85.
Fließzellen-
85.
Bildgebungs- Gesamtanzahl der
oberfläche aufgenommenen Platten
38 Platten insgesamt
Unterseite
38 Platten insgesamt
Unterseite
28 Platten insgesamt
Unterseite
Material-Nr. 20000262
Dokument-Nr. 15027617 v01 DEU