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NovaSeq X Plus Produktdokumentation
Überwachen des Lauffortschritts
Sie können auf dem Bildschirm „Sequencing" (Sequenzierung) den Lauffortschritt überwachen, einen
Lauf abbrechen oder einen neuen Lauf starten. Sie können den Lauffortschritt auf dem Gerät oder über
einen Computer mit Internetverbindung überwachen. Wenn die Cloud-Laufüberwachung aktiviert ist,
können Sie den Lauffortschritt im BaseSpace Sequence Hub anzeigen. Weitere Einzelheiten zum Lauf
und Laufstatus finden Sie unter
Um zusätzliche Metriken und Visualisierungen anzuzeigen, können Sie den Sequenzierungsanalyse-
Viewer (SAV) verwenden. Weitere Informationen zum SAV finden Sie auf der
Support-Seite im
Internet.
Wenn der Lauf abgebrochen wird, bevor die Nachwaschung abgeschlossen ist, führen Sie einen
Wartungswaschlauf durch, bevor Sie mit einem neuen Sequenzierungslauf beginnen. Anweisungen
finden Sie unter
Durchführen eines Wartungswaschlaufs auf
1.
Überwachen Sie den Laufstatus auf dem Bildschirm Sequencing (Sequenzierung) oder unter der
Registerkarte „Active" (Aktiv) auf dem Bildschirm „Runs" (Läufe).
Der Bildschirm „Sequencing" (Sequenzierung) enthält die geschätzte Uhrzeit für den Abschluss des
Laufs. Für die Berechnung von präzisen Abschlusszeiten sind zehn bereits abgeschlossene Läufe
erforderlich.
Der Bildschirm „Runs" (Läufe) enthält zusätzliche Informationen zum Laufstatus. Die folgenden
Informationen zum Laufstatus, einschließlich der Uhrzeit, zu der der Vorgang gestartet und
abgeschlossen wurde, sind unter der Registerkarte „Active" (Aktiv) verfügbar:
Analysedatenübertragung
•
Sequenzierungsdatenübertragung
•
Externe Dateiübertragung
•
Zur Analyse in die Warteschlange gestellt
•
•
Sekundäranalyse
2.
Überwachen Sie die folgenden Metriken auf dem Bildschirm „Sequencing" (Sequenzierung) oder
„Runs" (Läufe).
% ≥ Q30: Der durchschnittliche Prozentsatz von Base-Calls mit einem Q-Score ≥ 30.
•
Yield (Ausbeute): Die erwartete Anzahl von Base-Calls für den Lauf.
•
Total Reads PF (PF-Reads insgesamt): Anzahl der Paired-Ends-Reads (falls zutreffend) nach
•
Filterung (in Millionen).
3.
Um weitere Laufdetails anzuzeigen, wählen Sie den Laufnamen auf dem Bildschirm „Sequencing"
(Sequenzierung) oder die Registerkarte „Active" (Aktiv) auf dem Bildschirm „Runs" (Läufe).
4.
Nachdem der Lauf abgeschlossen ist, können Sie zusätzliche Laufergebnisse anzeigen, indem Sie
den Laufnamen auf dem Bildschirm „Sequencing" (Sequenzierung) oder die Registerkarte
„Completed" (Abgeschlossen) auf dem Bildschirm „Runs" (Läufe) wählen.
Dokument-Nr. 200027529 Version 02
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in Diagnoseverfahren.
Laufverwaltung auf
Seite 15.
Real-Time Analysis
Seite 134.
81
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