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Rta-Fehler; Fehlerbehandlung; Workflow Für Die Rehybridisierung - illumina MiniSeq Systemhandbuch

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MiniSeq Systemhandbuch
Temporäre Dateien können den freien Speicherplatz der Festplatte füllen. Es wird empfohlen, einen
Netzwerkspeicherort für die Laufdaten festzulegen und eine angemessene Aufbewahrungsvorschrift für Local
Run Manager entsprechend der Anzahl der durchzuführenden Läufe auszuwählen.

RTA-Fehler

Zum Beheben von Fehlern, die bei RTA aufgetreten sind, prüfen Sie zunächst das RTA-Fehlerprotokoll. Diese
Datei wird im Ordner RTALogs gespeichert. Wenn der Lauf erfolgreich durchgeführt wurde, ist die Datei nicht
vorhanden. Fügen Sie das Fehlerprotokoll bei, wenn Sie sich wegen Problemen an den technischen Support
von Illumina wenden.

Fehlerbehandlung

RTA2 erstellt Protokolldateien und speichert sie im Ordner „RTALogs". Fehler werden im *.tsv-Format in einer
Fehlerdatei aufgezeichnet.
Wenn die Verarbeitung abgeschlossen ist, werden die folgenden Protokoll- und Fehlerdateien an das
endgültige Ausgabeziel übertragen:
*GlobalLog*.tsv enthält eine Zusammenfassung wichtiger Laufereignisse.
u
*LaneNLog*.tsv listet die Verarbeitungsereignisse auf. Auf einer MiniSeq-Fließzelle ist N immer 1.
u
*Error*.tsv protokolliert während des Laufs aufgetretene Fehler.
u
*WarningLog*.tsv führt während des Laufs aufgetretene Warnungen auf.
u
Workflow für die Rehybridisierung
Wenn die während der ersten Zyklen generierten Kennzahlen eine Intensität von unter 2.500 aufweisen, ist
möglicherweise ein Rehybridisierungslauf erforderlich. Bestimmte Bibliotheken mit geringer Varianz können
Intensitäten von unter 1.000 aufweisen. Dies ist normal und lässt sich nicht durch eine Rehybridisierung
beheben.
HINWEIS
Der Befehl zum Beenden eines Laufs ist endgültig. Der Lauf kann nicht wieder aufgenommen werden, die
Verbrauchsmaterialien des Laufs können nicht wiederverwendet werden und die Sequenzierungsdaten des
Laufs werden nicht gespeichert.
Wenn Sie einen Lauf beenden und die Fließzelle speichern, führt die Software die folgenden Schritte durch,
bevor der Lauf beendet wird:
Versetzt die Fließzelle in einen sicheren Zustand.
u
Entsperrt die Fließzellen-RFID für einen nachfolgenden Lauf.
u
Weist der Fließzelle ein Verfallsdatum für die Rehybridisierung zu.
u
Erstellt die Laufprotokolle für abgeschlossene Zyklen. Eine Verzögerung ist normal.
u
Übergeht die automatische Nachwaschung.
u
Wenn Sie einen Rehybridisierungslauf starten, führt die Software die folgenden Schritte durch, um den Lauf
durchzuführen:
Erstellt einen Laufordner basierend auf einem eindeutigen Namen des Laufs.
u
Prüft, ob das Datum der Fließzellenrehybridisierung abgelaufen ist.
u
Füllt die Reagenzien vor. Eine Verzögerung ist normal.
u
Überspringt den Clustering-Schritt.
u
Dokument-Nr. 1000000002695 v03 DEU Material-Nr. 20014309
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in Diagnoseverfahren.
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