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R-Biopharm RIDA CYCLER Bedienungsanleitung

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R-Biopharm – Ihr Partner für Analytik und Diagnostik
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Bedienungsanleitung

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Verwandte Anleitungen für R-Biopharm RIDA CYCLER

Inhaltszusammenfassung für R-Biopharm RIDA CYCLER

  • Seite 1 R-Biopharm – Ihr Partner für Analytik und Diagnostik RIDA®CYCLER Bedienungsanleitung...
  • Seite 2 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung...
  • Seite 3 2019 R-Biopharm AG, Darmstadt Bedienungsanleitung ® RIDA CYCLER ZRCYCLER Version 1.2.0 (28.11.2019) © Copyright 2019 by R-Biopharm AG Vertrieb: R-Biopharm AG An der neuen Bergstraße 17 64297 Darmstadt, Deutschland Telefon: +49 (0) 61 51 - 8102-0 Fax: +49 (0) 61 51 - 8102-40 E-Mail: info@r-biopharm.de...
  • Seite 4 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Bedienungsanleitung...

  • Seite 5: Inhaltsverzeichnis

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Inhaltsverzeichnis Allgemeine Informationen ........................8 Wichtige Informationen.......................... 8 Erklärung der verwendeten Symbole ....................8 Verwendungszweck ..........................10 1 Auspacken und Installation ......................11 1.1 Installation ............................11 1.2 Installation der Software ........................11 1.3 Software aktualisieren ........................
  • Seite 6 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 9.1.5 Auswahl Probentyp ........................36 9.1.6 Probenkonzentrationen ......................... 36 9.1.7 Multiplex-Standards ........................38 9.1.8 Verknüpfen eines Tests mit einer Probe ..................38 9.1.9 Optionale Spalten .......................... 39 9.1.10 Proben importieren ........................39 9.1.11 Warnungen im Probeneditor ....................... 40 9.1.12 Probeneditor sperren ........................
  • Seite 7 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 14.2.1 Laufeigenschaften ........................69 14.2.2 Proben ............................70 14.2.3 Analyse ............................70 14.3 Berichtsoptionen ..........................71 15 Excel-Arbeitsmappe ........................72 Hinweise und Anhang .......................... 74 Technische Daten, Umgebungsbedingungen ..................74 Informationen zur biologischen Sicherheit ..................... 74 ®...

  • Seite 8: Allgemeine Informationen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Allgemeine Informationen Bitte vergleichen Sie den Inhalt dieser Lieferung sorgfältig mit dem beigelegten Lieferschein, der Packungsbeilage oder der Rechnung. Wir empfehlen Ihnen, eine Kopie dieses Dokuments zusammen mit der Bedienungsanleitung aufzubewahren, damit Sie bei zukünftigen Anfragen, Nachbestellungen oder Servicearbeiten Informationen zu Datum und Umfang der Lieferung schnell zur Hand haben.
  • Seite 9 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Warnungen für die richtige Verwendung Warnhinweis! Beschädigter Deckel ® Verwenden Sie den RIDA CYCLER nicht, wenn der Deckel Bruchstellen aufweist oder der Deckelverschluss beschädigt ist. Es besteht ein hohes Verletzungsrisiko für den Benutzer durch sich bewegende, unter Strom stehende oder heiße Teile. Warnung, Möglichkeit eines elektrischen Schlags! Lebensgefährliche Spannung im Inneren des Geräts ®...

  • Seite 10: Verwendungszweck

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Warnhinweis! Seitliche Öffnungen nicht blockieren. Achten Sie darauf, dass die seitlichen Öffnungen nicht blockiert sind, um die Kühlung des Geräts nicht zu beeinträchtigen. Warnhinweis! Gerät während des Betriebs nicht bewegen. ® Bewegungen können die ordnungsgemäße Funktion des RIDA CYCLER beeinträchtigen und zu falschen Daten führen.

  • Seite 11: Auspacken Und Installation

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 1 Auspacken und Installation ® Die folgenden Teile sind in der RIDA CYCLER Transportverpackung enthalten: • ® RIDA CYCLER Gerät (mit Röhrchenklammer im Inneren) • Netzteil • Stromkabel • USB-Kabel, 2 m • ®...

  • Seite 12: Software Aktualisieren

    Abb. 1: Alle angeschlossenen Geräte sind nun betriebsbereit. 1.3 Software aktualisieren Informationen über neue Software-Updates erhalten Sie über den R-Biopharm Newsletter. Überprüfen Sie trotzdem regelmäßig die Website (www.r-biopharm.com) auf neu verfügbare Software- und Firmware-Updates oder wenden Sie sich an Ihren Ansprechpartner bei R-Biopharm.

  • Seite 13: Rida ® Cycler: Übersicht

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung ® 2 RIDA CYCLER: Übersicht 1 Rotor - Aluminiumrotor mit 48 Probenpositionen. Eine Kennzeichnung der Probenpositionen erleichtert die korrekte Beladung der Reaktionsröhrchen. 2 Röhrchenklammer - Fixiert die Reaktionsröhrchen im Rotor. 3 Deckelverschluss - Mechanismus zur Verriegelung des Deckels während eines Laufs.

  • Seite 14: Verbrauchsmaterialien Und Zubehör

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 3 Verbrauchsmaterialien und Zubehör Netzteil Externe Stromversorgung für den ® RIDA CYCLER. (Art. Nr. ZRC-MIC-PA) Im Lieferumfang des Geräts enthalten. Röhrchen und Kappen Streifen aus vier Reaktionsgefäßen mit einem Volumenbereich von 5 – 30 μL.

  • Seite 15: Farben Der Led-Anzeige

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 4 Farben der LED-Anzeige Die LED-Anzeige ändert ihre Farbe und blinkt bei bestimmten Gerätevorgängen. ® Blau dauerhaft: Der RIDA CYCLER ist eingeschaltet und einsatzbereit (Idle). ® Blau blinkend: Der RIDA CYCLER wurde zum Start eines Laufs ausgewählt.
  • Seite 16 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Stellen Sie sicher, dass bei Verwendung einer Mehrkanalpipette nur die ersten sechs Spitzenpositionen verwendet werden und nicht alle acht. Grün hervorgehobene Kavitäten folgen der standardmäßigen Bestückungsausrichtung (A1, B1, C1 ...). Blau hervorgehobene Kavitäten folgen der Mehrkanalpipetten- Bestückungsausrichtung (A1, A2, A3 ...).

  • Seite 17: Röhrchen Entnehmen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Verwenden Sie mit Wasser befüllte Röhrchen (Tara-Röhrchen) für die unbesetzten Kavitäten im Rotor. Kavitäten ohne Röhrchen, mit leeren Röhrchen sowie Röhrchen mit unterschiedlichen Flüssigkeitsmengen weisen unterschiedliche Wärmelasten auf dem Metallrotor auf. Wärmelastschwankungen um den Rotor herum können sowohl bei statischen Temperaturen als auch während des Hochfahrens signifikante Wärmegradienten verursachen.

  • Seite 18: Tool Bar (Symbolleiste)

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 8: Übersicht Hauptmenü 6.1 Tool Bar (Symbolleiste) Der obere Abschnitt der Benutzeroberfläche wird als Tool bar (Symbolleiste) bezeichnet und besteht aus folgenden Funktionen: Abb. 9: Übersicht Tool Bar (Symbolleiste) ® Help (Hilfe) Zugriff auf RIDA CYCLER Manual (Bedienungsanleitung), Create Support Package (Support-Paket erstellen), Install Template (Template...

  • Seite 19: Hilfe-Symbol

    Protokolldatei des Laufs. Wählen Sie einen Ordner zum Speichern des Support-Pakets aus. Senden Sie die gezippte Support- Paket-Datei per E-Mail an pcr@r-biopharm.de. Install Template Laden Sie von R-Biopharm zur Verfügung gestellte Templates über den ® (Vorlage installieren) Menüpunkt „Install Template“ in die RIDA CYCLER Software.

  • Seite 20: Geräte-Symbol

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 6.1.3 Geräte-Symbol Geräte, die mit dem PC kommunizieren, werden in der Symbolleiste mit Hilfe eines Instrument icons (Geräte-Symbol) angezeigt. ® Ein Bluetooth oder USB-Symbol zeigt den Typ der hergestellten Verbindung an. Die Seriennummer bzw. der Name des Geräts werden neben dem Kommunikationssymbol angezeigt. ®...
  • Seite 21 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 12: Option Hide instrument (Gerät ausblenden) Properties Hier können Sie den Namen des Geräts ändern. Zudem sind (Eigenschaften) Informationen zu Seriennummer und Firmware-Version hinterlegt. Update Firmware Das Updaten der Geräte-Firmware ist nur nach bestimmten Updates ®...

  • Seite 22: Symbol Gerätekommunikation

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 6.1.4 Symbol Gerätekommunikation Das Symbol für die Gerätekommunikation wird verwendet, um nach Geräten in der Nähe über ® Bluetooth und/oder USB zu suchen. Beim Start der Software blinkt das Symbol automatisch und zeigt an, dass die Software nach Geräten sucht.

  • Seite 23: Aktive Fenster Datei

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 17: Navigator Bar (Navigationsleiste) für Läufe (links) und Projekte (rechts) 6.4 Aktive Fenster Datei Im zentralen Bereich der Benutzeroberfläche befinden sich segmentierte Fenster, die für einen bestimmten Bereich der Navigationsleiste aktiv sind. Abb.

  • Seite 24: Export In Csv Oder Kopieren In Die Zwischenablage

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Raw Data (Rohdaten) Die Daten werden während des Laufs in Echtzeit aktualisiert und stehen nach abgeschlossenem Lauf zur Verfügung. Die Diagramme werden während eines Laufs automatisch skaliert, können bei Bedarf aber auch manuell angepasst werden. Analysis graph Analysierte Daten, die je nach gewählter Analyse in einem bestimmten (Analysediagramm)

  • Seite 25: Organisation Der Ergebnistabelle

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 21: Symbol zum Kopieren von Diagrammen in die Zwischenablage Fügen Sie das Bild als Bitmap in die Software zur Dokumentenverarbeitung von Drittanbietern ein. Das Bild sollte für Veröffentlichungszwecke von ausreichender Qualität sein. Abb.

  • Seite 26: Größeneinstellungsleisten

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 6.4.5 Größeneinstellungsleisten Die Breite oder Höhe dieser Fenster, relativ zueinander, kann mit den Größeneinstellungsleisten eingestellt werden. Abb. 24: Größeneinstellungsleisten, hervorgehoben in Rot. 6.4.6 Funktionen zur Anzeige von Diagrammen Es stehen drei Funktionen zur Anzeige von Diagrammen zur Verfügung: Abb.

  • Seite 27: Samples Selector (Probenauswahl)

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 7 Samples Selector (Probenauswahl) Wählen Sie mit dem Samples selector (Probenauswahl) auf der rechten Seite der Benutzeroberfläche bestimmte Proben an und ab, indem Sie auf die Probenleiste klicken. Alternativ können Sie nur die benannten Proben mit Select Name (Name auswählen) oder alle Proben mit Select All (Alle auswählen) auswählen, oder alle Proben mit Select None (Keine auswählen) abwählen.

  • Seite 28: Probenauswahl-Gruppierung

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Um eine Probe nur in einem Diagramm auszublenden und sie nicht aus der Analyse zu entfernen, verwenden Sie das View icon (Anzeige-Symbol) in der Probenauswahl. Es gibt auch die Optionen Show All (Alle anzeigen) oder Hide All (Alle ausblenden). Abb.

  • Seite 29: Neuen Lauf Erstellen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 8 Neuen Lauf erstellen Wählen Sie New (Neu) im Symbolleisten-Menü und anschließend das Template (Vorlage) für Ihren Lauf aus. Abb. 31: Fenster zur Template (Vorlage)- Auswahl 8.1 Tests hinzufügen Wählen Sie die Assays (Tests) aus, die für den Lauf benötigt werden, indem Sie die Schaltfläche Add (Hinzufügen) auswählen.

  • Seite 30: Kompatibilität Des Testprofils

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Wählen Sie mithilfe des Dateisymbols einen Test aus einem beliebigen Verzeichnis aus. Verwenden Sie den Datei-Explorer, um den von Ihnen benötigten Test zu finden, einschließlich Netzwerklaufwerken oder externen Festplatten wie einem USB-Stick. Abb. 33: Shortcut-Bibliothek Sie können einen neuen Personal Shortcut (Persönliche Verknüpfung) für eine Test-Bibliothek erstellen.

  • Seite 31: Add Without Modification (Ohne Modifikation Hinzufügen)

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Modify Run Das Profil des Laufs wird so geändert, dass es mit dem ausgewählten (Lauf modifizieren) Assay kompatibel ist. Dies kann dazu führen, dass bestehende Assays inkompatibel werden. Modify Assay Das thermale Profil des zuletzt ausgewählten Assays (welches die (Test modifizieren) Fehlermeldung hervorgerufen hat) wird an das thermale Profil des zuvor ausgewählten Templates angepasst.
  • Seite 32 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Nur Geräte in Idle (Leerlauf) können ausgewählt werden, um einen Lauf zu starten. Abb. 38: Verfügbare Geräte werden in der Symbolleiste angezeigt Wenn das Gerät ausgewählt ist, starten Sie den Lauf, indem Sie die Option Start Run in der Dropdown-Liste auswählen.

  • Seite 33: Probeneditor

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 9.1 Probeneditor Unter Samples editor (Probeneditor) können die Proben in Tabellenformat angezeigt und annotiert werden. Die Informationen zu den einzelnen Proben können vor, während oder nach einem Lauf bearbeitet werden. Wenn Proben nicht ordnungsgemäß mit Informationen versehen sind, kann dies die Analyse erschweren.

  • Seite 34: Farbkennzeichnung

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 9.1.3 Farbkennzeichnung Wählen Sie die gewünschte Color (Farbe) für jede Probe (optional). Wählen Sie eine beliebige Farbe aus der Farbpalette oder erstellen Sie Ihre eigenen Farben mit Hilfe der Farbkarte. Um einen Farbverlauf zu erstellen, wählen Sie die erste Farbe und markieren Sie bis zur letzten gewünschten Farbe.
  • Seite 35 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Markieren Sie nun alle Zellen, die zum Ausfüllen der Namen und Replikate erforderlich sind. Klicken Sie auf das Symbol Auto fill (Automatisch Ausfüllen). Die fortlaufenden Namen basieren auf den ersten beiden Eingaben und die Replikate für jeden Namen werden automatisch ausgefüllt.

  • Seite 36: Auswahl Probentyp

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 9.1.5 Auswahl Probentyp Wählen Sie den Type (Typ) der Probe aus. Es stehen sieben Optionen zur Auswahl. Der gewählte Typ bestimmt die Art und Weise, in der die Probe während der Analyse von der Software verarbeitet wird. Um mehrere Zellen gleichzeitig zu ändern, markieren Sie die Zellen, drücken die F2-Taste auf Ihrer Tastatur und wählen dann aus den folgenden Optionen aus: Unknown (Unbekannt):...
  • Seite 37 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Geben Sie den ersten Konzentrationswert (20.000) ein. Lassen Sie die gleiche Anzahl von Zeilen wie die Anzahl der erforderlichen Replikate unter der ersten Konzentration leer. Geben Sie die zweite Konzentration der Verdünnungsreihe (10.000) ein. Markieren Sie nun alle Zellen, die zur Vervollständigung der Verdünnungsreihe und Replikate erforderlich sind.

  • Seite 38: Multiplex-Standards

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 9.1.7 Multiplex-Standards Sie können Standardkonzentrationen für jeden Kanal einzeln eingeben. Wählen Sie das Symbol Toggle between single and multiplex standards (Zwischen Single- und Multiplex-Standards wechseln), um diese Option zu verwenden. Sie müssen sicherstellen, dass der Test als Multiplex eingerichtet wurde. Ein Wechsel zwischen Single und Multiplex ist möglich.

  • Seite 39: Optionale Spalten

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 47: Fenster zur Auswahl von Available Assays (Verfügbare Tests) 9.1.9 Optionale Spalten Zusätzliche Spalten können dem Samples Editor (Probeneditor) mit dem Symbol Select visible sample data columns (Sichtbare Probendatenspalten auswählen) hinzugefügt werden. Die folgenden Spalten können der Tabelle hinzugefügt oder aus der Tabelle entfernt werden: Standard Concentration (Standardkonzentration): Die Konzentrationen werden für die Standardkurvenanalyse verwendet.

  • Seite 40: Warnungen Im Probeneditor

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 49: Beispiel für Probendaten Wählen Sie das Symbol Import Samples (Proben importieren), um Probendaten aus einer anderen Quelle zu importieren. Sie können aus allen durch Komma, Tabulator oder Leerzeichen getrennten Dateien importieren. Suchen und wählen Sie die zu importierende Datei.

  • Seite 41: Probeneditor Sperren

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 51: Beispiel eines möglichen Warnhinweises 9.1.12 Probeneditor sperren Alle Felder können gesperrt werden, um versehentliche Änderungen zu verhindern. Nach dem Sperren ist keines der Felder annotierbar, bis es wieder entsperrt wird. Abb. 52: Symbol für Probeneditor sperren 9.1.13 Informationen Geben Sie den Namen für den Operator (Bediener) ein (optional).

  • Seite 42: Eine Vorlage Öffnen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 54: Schaltfläche Save as (Speichern unter) 10.2 Eine Vorlage öffnen Installieren Sie eine Vorlage (Schaltfläche Help (Hilfe) in der Symbolleiste). Wählen Sie in der Schaltfläche New (Neu) auf der Symbolleiste die Vorlage aus. Der Lauf wird mit allen gespeicherten Parametern, einschließlich der Probenannotationen, geöffnet.

  • Seite 43: Daten

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Einen Lauf abbrechen Sie können den Lauf jederzeit abbrechen, indem Sie im Fenster Run Summary (Laufübersicht) die Funktion Abort (Abbrechen) wählen. Warnung, heiße Oberfläche! Bei einem benutzerseitig abgebrochenen Lauf, den Deckel nicht öffnen, bis das Gerät abgekühlt ist.

  • Seite 44: Analyse

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 12 Analyse In der Software stehen folgende Analysetypen zur Verfügung: Cycling, Melt (Schmelzkurvenanalyse), Absolute Quantification (Absolute Quantifizierung), Allelic Discrimination (Allelische Diskriminierung) und Identifier. Analysenspezifische Parameter können bearbeitet werden. Berichtstabellen werden zusammen mit verschiedenen Diagrammen, je nach Analysetyp, angezeigt. Um eine neue Analyse zu starten, wählen Sie in der Navigationsleiste die Schaltfläche Add (Hinzufügen) neben dem Analysetyp aus.

  • Seite 45: Diagrammtypen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 58: Fenster Cycling Analysis (Cycling-Analyse) 12.1.1 Diagrammtypen Abb. 59: Schaltflächen zum Wechseln zwischen verschiedenen Diagrammtypen Derivatives (Ableitungen): Die Kurven der ersten und zweiten Ableitung für die ausgewählten Daten können parallel zu den Baseline-korrigierten Amplifikationskurven angezeigt werden.
  • Seite 46 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 60: Optionen der Cycling-Analyse Linear y-Axis (Lineare y-Achse): Lassen Sie sich die Baseline-korrigierten Cycling-Daten mit der y-Achse in linearer Skalierung anzeigen, indem Sie das Symbol für die lineare y-Achse auswählen. Abb. 61: Lineare y-Achse...

  • Seite 47: Parameter Der Cycling-Analyse

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Log y-Axis (Logarithmische y-Achse): Die Anzeige der Daten in der logarithmischen Ansicht ermöglicht eine bessere Visualisierung des exponentiellen Bereichs der Amplifikationskurve und ist daher die Standardoption. Sie können zur logarithmischen Skala zurückkehren, indem Sie das Symbol für Log y-Achse auswählen.
  • Seite 48 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 63: Symbol Auto set threshold (Schwellenwert automatisch einstellen) Manuelle Anpassung des Schwellenwerts Um den Threshold manuell einzustellen, ist die Funktion Auto set threshold zu deaktivieren. Anschließend kann der gewünschte Schwellenwert manuell eingegeben oder per Pfeiltasten eingestellt werden.
  • Seite 49 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Fluorescence Cutoff (Fluoreszenz-Cutoff): Dieser Parameter schließt Proben aus, die unter den definierten Prozentsatz der maximalen Fluoreszenzänderung fallen. Geringe Veränderungen der Fluoreszenz können die Bestimmung der Cq -Werte durch Verändern des W-o-L stören. Einige dieser kleinen Veränderungen können auf Selbsthydrolyse der Sonden und gegenseitige Beeinflussung von Farbstoffen zurückgeführt werden.

  • Seite 50: Tabelle „Ergebnisse Cycling-Analyse

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Wenn eine nicht ausgeschlossene Probe aus der Berechnung des Linearitätsfensters ausgeschlossen wurde, besitzt sie keine Berechnung des Effizienz- oder R -Wertes und ihr Eintrag in der Spalte Result (Ergebnis) in der Tabelle Cycling Analysis Results (Ergebnisse Cycling-Analyse) wird auf Excluded from WOL (Von W-o-L ausgeschlossen) gesetzt.

  • Seite 51: Unverankerte Fenster (Floating Windows)

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Um die Proben in Replikaten in alphanumerischer Reihenfolge zu sortieren, verwenden Sie die Option Group by this column (Nach dieser Spalte gruppieren). Andernfalls wählen Sie die Option Ungroup (Gruppierung aufheben), damit die Proben in der Reihenfolge der Kavitätennummer angezeigt werden. Die einzelnen Proben können für jede Spalte für gruppierte und nicht gruppierte Tabellen in Ascending or Descending (Aufsteigender oder Absteigender) Reihenfolge sortiert werden.

  • Seite 52: Schmelzkurvenanalyse (Melt)

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 70: Unverankertes Fenster Wählen Sie das Löschsymbol in der oberen rechten Ecke des unverankerten Fensters aus, um das unverankerte Fenster zu schließen. 12.2 Schmelzkurvenanalyse (Melt) Mit der Schmelzkurvenanalyse kann die Peak-Dissoziationstemperatur (T ) einer Probe aus den Schmelzdaten bestimmt werden.

  • Seite 53: Parameter Für Schmelzkurvenanalyse

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 71: Fenster Melt Analysis (Schmelzkurvenanalyse) 12.2.1 Parameter für Schmelzkurvenanalyse Folgende Parameter können angepasst werden: Abb. 72: Parameter in Schmelzkurvenanalysen Threshold (Schwellenwert): Ändern Sie den Schwellenwert, indem Sie entweder die rote Linie im Diagramm nach oben oder unten verschieben oder einen Zahlenwert in das Feld Threshold (Schwellenwert)

  • Seite 54: Absolute Quantifizierung

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 12.3 Absolute Quantifizierung Mit dieser Analyseoption können Sie die unbekannte Konzentration einer Probe anhand einer Standardkurve quantifizieren. Darüber hinaus kann, zusammen mit einem Referenzmaterial bekannter Allergenkonzentration, der Gehalt an unbekannten Proben mit Einheiten wie z.B. ppm charakterisiert werden.

  • Seite 55: Importieren Einer Standardkurve

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung − 1 −1 ���������������� ���� ������������ Aus der Steigung der Geraden wird die Effizienz mit der Gleichung berechnet und als ein Wert von 0 bis 1 ebenfalls angezeigt. Abb. 74: Übersicht Standard Curve Characteristics (Standardkurven Charakteristika) R-Quadrat-Wert: Der R -Wert ist ein Maß...

  • Seite 56: Ergebnistabelle Für Die Standardkurve

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Wenn Sie keinen Standardkalibrator anwenden, wird eine Warnung oberhalb der Standardkurve angezeigt. Eine Warnung wird auch angezeigt, wenn der Standardkalibrator eine Abweichung von ± 1 Zyklus aufweist. 12.3.4 Ergebnistabelle für die Standardkurve Die Standard Curve Results table (Ergebnistabelle für die Standardkurve) enthält die folgenden Kennzahlen: (crossing point): Quantifizierungszykluswert für einen einzelnen Standard.

  • Seite 57: Absolute Quantifizierung

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 78: Navigationsleiste Absolute Quantifizierung 12.3.6 Absolute Quantifizierung Die Analysemethode Absolute Quantification (Absolute Quantifizierung) besitzt alle Funktionen, die im Abschnitt Standard Curve Analysis (Standardkurvenanalyse) beschrieben sind, erweitert um die zusätzliche Bestimmung unbekannter Konzentrationen mit Hilfe von Referenzmaterial. Im Diagramm für die Standardkurve werden Standards als blaue Punkte, Unbekannte als rote Punkte und Referenzmaterial als grüne Punkte dargestellt.

  • Seite 58: Probenergebnistabelle

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 12.3.7 Probenergebnistabelle In der Tabelle Sample Results table (Probenergebnistabelle) wird die Calculated Concentration (Berechnete Konzentration) für jede unbekannte Probe angezeigt. Der Mittelwert und die Standardabweichung für eine Reihe von Replikaten werden ebenfalls in der obersten Zeile für die Reihe angezeigt.

  • Seite 59: Parameter Für Allelische Diskriminierung

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Vorhandensein beider Allele deutet auf Heterozygotie hin. Abb. 81: Fenster Allelic Discrimination (Allelische Diskriminierung) 12.4.1 Parameter für Allelische Diskriminierung Stellen Sie den Threshold (Schwellenwert) manuell auf ein Level ein, das erforderlich ist, um jedes Allel vom Hintergrund-Signal-Level zu unterscheiden.

  • Seite 60: Identifier

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 12.5 Identifier Normalisierte real-time-PCR-Kurven werden für jedes Target in einem Analysediagramm, in linearer Darstellung, abgebildet. Es besteht die Möglichkeit, alle Targets im gleichen Diagramm oder in einzelnen Diagrammen anzeigen zu lassen. Bei der Darstellung in einzelnen Diagrammen erfolgt die Auswahl des gewünschten Targets über die Diagrammreiter.

  • Seite 61: Projekte

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 13 Projekte Die Funktion Projects (Projekte) ermöglicht es dem Anwender, mehrere Läufe in einer Analyse zu kombinieren. Bis zu zehn Durchläufe können pro Projekt kombiniert werden, so dass bis zu 480 Proben gleichzeitig analysiert werden können. Allgemeiner Sicherheitshinweis! In der aktuellen Software Version (1.2.0) ist diese Funktion nur für Cycling Analysen, Schmelzkurvenanalysen und Absolute Quantifizierung verfügbar.
  • Seite 62 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 87: Abrufen der Daten zu einzelnen Läufen Jeder Assay, der im Lauf-Set verwendet wurde, erscheint im Assay-Abschnitt der Navigationsleiste. Sie können sich die Assay-Einstellungen ansehen, indem Sie den Baum öffnen. Betrachten und/oder ändern Sie die Samples (Proben), die Sie im Abschnitt Project Setup (Projekteinstellungen) der Navigationsleiste bearbeiten.

  • Seite 63: Projektanalyse

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 89: Probenübersicht Geben Sie alle Informationen über das Projekt in das dafür vorgesehene Feld ein. Alle Vorgänge werden während der Analyse des Projekts aufgezeichnet und im Bereich Messages (Nachrichten) angezeigt. 13.1 Projektanalyse Wählen Sie die gewünschten Analysetyp über +, um eine neue Analyse zu starten.
  • Seite 64 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Alle Proben werden in einem Diagramm (Graphen) dargestellt. Abb. 90: Anzeige aller Proben in einem Graphen Alle gleichen Optionen, die für jeden Analysetyp zur Verfügung stehen, stehen für ein Project (Projekt) zur Verfügung (siehe Analyse). Die Ergebnistabellen sind ähnlich, jedoch werden die Ergebnisse für einzelne Proben mit Laufordnungsvoreinstellung für das Well (z.B.
  • Seite 65 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 91: Probenergebnistabelle Die Standardansicht für den Samples Selector (Probenselektor) ist in Läufe unterteilt, wobei der Laufname über der Liste der Proben angezeigt wird. Diese können über das kleine Dreieckssymbol ein- oder ausgeblendet werden.
  • Seite 66 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 92: Samples Selector (Probenselektor) Über den Samples Selector (Probenselektor) können die Proben auch sortiert nach Assays, Sample Groups (Probengruppen), Sample Name (Probenname) oder None (keine) (well order (Well- Reihenfolge)) angezeigt werden. Die Gruppen können auch innerhalb des Samples Selectors (Probenselektors) über die Gruppierungsfunktion ein- oder ausgeblendet werden.

  • Seite 67: Einstellung Von Konzentrationen Für Projekte (Über Analyseoption „Absolute Quantification")

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 13.2 Einstellung von Konzentrationen für Projekte (über Analyseoption „Absolute Quantification“) Die Einstellung der Einzelkonzentration vs. Kanalkonzentration wird aus dem ersten Importlauf übernommen. Wenn die Konzentrationseinheiten unterschiedlich sind, werden sie auf "mixed (gemischt)" umgestellt und der Anwender muss sie selbst auflösen. Abb.

  • Seite 68: Berichte

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 14 Berichte Erstellen Sie einen Bericht für jeden Run (Lauf) mit der Schaltfläche Reports + (Berichte +) im Run Navigator (Laufnavigator). Ein Standardbericht enthält Informationen zu Run Properties (Laufeigenschaften), Samples (Proben), Run Profile (XYZ) und den in Analysis (Analyse)angezeigten und ausgewerteten Fluoreszenzkanälen.

  • Seite 69: Laufeigenschaften

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 96: Berichtvorschau 14.2.1 Laufeigenschaften Der Abschnitt Run Properties (Laufeigenschaften) enthält die folgenden Informationen: Name Der vom Benutzer gewählte Name des Laufs File (Datei) Der Verzeichnispfad in dem die Laufdatei abgespeichert wurde Status Valide oder invalide Operator (Bediener) Name der Person, die den Lauf durchgeführt hat.

  • Seite 70: Proben

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 14.2.2 Proben Der Samples editor (Probeneditor) wird in der Berichtsvorschau dargestellt, einschließlich Well, Name, Type (Typ) der Proben, Standardkonzentrationen und Assays (Tests). Unabhängig von der tatsächlichen Probenanzahl werden in diesem Abschnitt immer alle 48 Kavitäten aufgelistet. 14.2.3 Analyse Die Analysen werden entsprechend der bereitgestellten Informationen dargestellt.

  • Seite 71: Berichtsoptionen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 14.3 Berichtsoptionen Abb. 98: Menüleiste mit weiteren Berichtsoptionen Search (Suchen) Suchen Sie in der Berichtsvorschau ein Wort oder eine Zeichenfolge. Geben Sie den/die Suchbegriff(e) ein, um sie im Bericht zu finden. Die gefundenen Begriffe werden in der Vorschau blau hervorgehoben und können nacheinander mit der Enter-Taste betrachtet werden.

  • Seite 72: Excel-Arbeitsmappe

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung 15 Excel-Arbeitsmappe Konvertieren Sie eine Laufdatei in eine Excel-Arbeitsmappe mit Arbeitsblättern für jeden Abschnitt. Führen Sie folgende Schritte aus, um eine Excel-Arbeitsmappe aus Ihrer Laufdatei zu erstellen: Klicken Sie auf Save As (Speichern unter). Wählen Sie dann Excel Workbook (Excel-Arbeitsmappe) (*.xlsx) aus den Optionen für Save As Type (Speichern unter Typ).
  • Seite 73 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abb. 100: Excel-Arbeitsmappe Cycling Results (Analyse Ergebnisse)

  • Seite 74: Hinweise Und Anhang

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Hinweise und Anhang Technische Daten, Umgebungsbedingungen Abmessungen B: 150 mm, L: 150 mm, H: 130 mm (265 mm bei geöffnetem Deckel) 2,1 kg Gewicht 100 - 240 VAC, 50/60 Hz 4,0 A Wechselstromeingang ±...

  • Seite 75: Dekontamination Des Rida ® Cycler

    Optional können Sie Druckluft verwenden, um die Kavitäten von Staub zu reinigen. • Wenn noch Spuren von Verunreinigungen vorhanden sind, wiederholen Sie den Vorgang noch einige Male. Im Zweifelsfall wenden Sie sich bitte an Ihren lokalen Distributor oder direkt an die R-Biopharm AG, Darmstadt. EG-Konformitätserklärung / CE-Zeichen ®...

  • Seite 76: Symbole Auf Dem Typenschild

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Symbole auf dem Typenschild Zulassungszeichen Dieses Gerät entspricht den geltenden technischen ACMA-Normen für EMV. FCC-Konformitätserklärung Dieses Gerät entspricht Teil 15 der FCC-Regeln. Der Betrieb unterliegt den folgenden zwei Bedingungen: (1) Dieses Gerät darf keine schädlichen Störungen verursachen und (2) dieses Gerät muss den Empfang von Interferenzen tolerieren, einschließlich Interferenzen, die einen unerwünschten Betrieb verursachen können.

  • Seite 77: Anhang 1: Temperature Verification System (Tvs)

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Anhang 1: Temperature Verification System (TVS) Das TVS kann verwendet werden, um sicherzustellen, dass die Temperaturregelung des ® RIDA CYCLER innerhalb der festgelegten Spezifikation arbeitet. Abb. 101: Temperature Verification System Warnhinweis! Der TVS-Sensor ist sehr empfindlich und über ein sehr dünnes Kabel mit dem Gehäuse verbunden.

  • Seite 78: Anhang 2: Fehlermeldungen Und Warnungen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Lassen Sie alle anderen Kavitäten leer. Nachdem der Sensor mit der Röhrchenklammer fixiert wurde, schließen Sie den Deckel und folgen den weiteren Anweisungen auf dem Bildschirm. Die Verifizierung kann bis zu 25 Minuten dauern. Am Ende haben Sie die Möglichkeit, Ihren Verifizierungsbericht zu speichern oder auszudrucken.

  • Seite 79: Anhang 3: Umgehungslösung Für Toshiba Bluetooth

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung ® Anhang 3: Umgehungslösung für Toshiba Bluetooth ® ® Wenn Sie einen Toshiba-Computer verwenden und über Bluetooth nicht mit dem RIDA CYCLER kommunizieren können, sollte folgende Umgehungslösung das Problem beheben. 1. Geräte-Manager öffnen. ®...

  • Seite 80: Anhang 4: Cfr 21, Part

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Anhang 4: CFR 21, Part 11 Der Code of Federal Regulations Tile 21 Part 11 (21CFR11) der US-amerikanischen Arzneimittelagentur Food and Drug Administration deckt die Vorschriften für elektronische Aufzeichnungen und elektronische Signaturen ab, um zu gewährleisten, dass diese vertrauenswürdig, zuverlässig und gleichwertig zu Papieraufzeichnungen sind.
  • Seite 81 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Im Panel Messages (Meldungen) wird pro Analyse ein einzelner Eintrag angezeigt, der die Änderungen zusammenfasst. Der Zeitstempel des Eintrags ist der Zeitpunkt von Run Save (Laufspeicherung) und nicht der der Änderung des Analyseparameters. Über die übrigen Verfahren haben wir keine Kontrolle, insbesondere, da sich einige von ihnen auf das gesamte Standardverfahren für einen Test- und/oder Qualitätsmanagementprozess beziehen, nicht nur auf die Software.
  • Seite 82 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung (2) Versions- und Änderungskontrollverfahren, um einen Prüfpfad zu pflegen, der die zeitliche Entwicklung und Änderungen der Systemdokumentation beschreibt”. Dies ist eine Betriebsanforderung des Unternehmens. Die Dateiverwaltung liegt beim Endbenutzer. Er muss die geeigneten Berechtigungen und den Dateispeicher so konfigurieren, dass sie diese Anforderungen erfüllen.

  • Seite 83: Anhang 5: Fluoreszenzfarbstoff-Tabelle

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Anhang 5: Fluoreszenzfarbstoff-Tabelle Farbstoff Anregung Emission Kanal Anwendung BEBO Interkalierend ® LC Green HRM Farbstoff ® SYTO HRM Farbstoff FAM™ (optimal) Konjugierte Markierung ® SYBR Green I Interkalierend ® RiboGreen RNA-Markierung ® PicoGreen dsDNA-Markierung ®...

  • Seite 84: Anerkennung Von Eingetragenen Marken

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Anerkennung von eingetragenen Marken ® ® und Reader sind eingetragene Marken von Adobe Systems Incorporated, San Jose CA USA. Adobe ® Bluetooth ist eine eingetragene Marke der Bluetooth SIG, Kirkland WA USA. ® ®...

  • Seite 85: Literatur

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Literatur 1. Bustin, S.A., Benes, V., Garson, J.A., Hellemans, J., Huggett, J., Kubista, M., Mueller, R., Nolan, T., Pfaffl, M.W., Shipley, G.L., Vandesompele, J., and Wittwer, C.T. (2009) The MIQE Guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments. Clin. Chem., 55: 611 –...

  • Seite 86: Abkürzungen

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Abkürzungen Konfidenzintervall (Confidence interval) Quantifizierungszyklus (Quantification cycle) Variationskoeffizient (Coefficient of variation) Extraktionskontrolle (Extraction control) Interne Amplifikationskontrolle (Internal amplification control) Nachweisgrenze (Limit of detection) No Template Control Polymerase-Kettenreaktion (Polymerase chain reaction) Positive Template Control qPCR Quantitative Echtzeit-PCR RNA-Integritätsnummer...

  • Seite 87: Glossar

    ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Glossar Analytische Genauigkeit Der Unterschied zwischen den experimentell gemessenen und tatsächlichen Konzentrationen. Analytische Genauigkeit des Tests innerhalb derselben Proben, die wiederholt in Wiederholbarkeit: demselben Test gemessen wurden. Wird auch als Intra-Assay- Varianz bezeichnet und als SD für die Cq-Varianz oder CV der Kopienanzahl/ Konzentrationsvarianz ausgedrückt.
  • Seite 88 ® RIDA CYCLER Version 1.2.0 | Bedienungsanleitung Bio Molecular Systems Pty Ltd Unit 5-3 Northward Street, Upper Coomera QLD 4209 Australien Telefon: +61 (02) 93321694 E-Mail: support@biomolecularsystems.com www.biomolecularsystems.com...

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