Plattennummerierung; Miniaturbildbenennung - illumina NextSeq 550 Systemhandbuch

NextSeq 550 Systemhandbuch

Plattennummerierung

Es gibt 12 Platten in jedem Bildstreifen eines Kamerasegments. Die Platten sind ungeachtet der
Bildstreifennummer und des Kamerasegments mit 01–12 nummeriert und werden mit zwei Ziffern dargestellt.
Abbildung 35 Plattennummerierung
Die vollständige Plattennummer umfasst fünf Ziffern, um die Position wie folgt darzustellen:
Oberfläche: 1 stellt die obere Oberfläche dar, 2 die untere Oberfläche
u
Bildstreifen: 1, 2 oder 3
u
Kamera: 1, 2, 3, 4, 5 oder 6
u
Platte: 01, 02, 03, 04, 05, 06, 07, 08, 09, 10, 11 oder 12
u
Beispiel: Die Plattennummer 12508 bedeutet obere Oberfläche, Bildstreifen 2, Kamera 5 und Platte 8.
Die vollständige fünfstellige Plattennummer wird im Dateinamen von Miniaturbildern und empirischen
Phasierungsdateien verwendet. Weitere Informationen hierzu finden Sie unter
Sequenzierungsausgabedateien

Miniaturbildbenennung

Bei jedem Zyklus während der Bildgebung wird von allen Kameras, oberen und unteren Oberflächen ein
Miniaturbild für jeden Farbkanal (rot und grün) für die Platten 1, 6 und 12 generiert. Miniaturbilddateien
werden im JPG-Format generiert.
Jedes Bild wird anhand der Plattennummer benannt. Es wird folgende Benennungskonvention, bei der alle
Namen mit s_ beginnen, angewendet:
Lane: 1, 2, 3 oder 4
u
Platte: Plattennummer mit fünf Ziffern, die die Oberfläche, den Bildstreifen, die Kamera und die Platte
u
angeben
Kanal: rot oder grün
u
Beispiel: s_3_12512_green.jpg. Dieser Dateiname bedeutet Lane 3, obere Oberfläche, Bildstreifen 2,
Kamera 5, Platte 12 und grüner Kanal.
Dokument-Nr. 15069765 v06 DEU
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in Diagnoseverfahren.
auf Seite 64.
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