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HiSeq X Ten
illumina HiSeq X Ten Handbücher
Anleitungen und Benutzerhandbücher für illumina HiSeq X Ten. Wir haben
1
illumina HiSeq X Ten Anleitung zum kostenlosen PDF-Download zur Verfügung: Systemhandbuch
illumina HiSeq X Ten Systemhandbuch (61 Seiten)
Sequenzgeber
Marke:
illumina
| Kategorie:
Laborzubehör & Laborgeräte
| Dateigröße: 2.44 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
7
Kapitel 1 Überblick
9
Einleitung Weitere Ressourcen Gerätekomponenten Überblick über die Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
9
Unterschiede Beim Illumina Seqlab-Workflow
9
Weitere Ressourcen
10
Fließzellenkammer
11
Statussymbole
13
Aktivitäts- und Sensoranzeigen
13
Status der Datenübertragung
14
Überblick über die Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
15
Strukturierte Fließzelle
15
Kapitel 2 Erste Schritte
16
Starten des Hiseq X-Systems
16
Gerätesteuerungscomputer - Best Practices
16
Anpassen der Systemeinstellungen
17
Definieren der Laufordnereinstellungen
17
Festlegen der LIMS-Voreinstellungen
17
Konfigurieren einer Domäne
18
Anzeigen und Senden von Gerätedaten
18
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien
19
Kapitel 3 Vorbereiten von Reagenzien
20
Einleitung
20
Vorbereiten von SBS-Reagenzien
20
Auftauen von SBS-Reagenzien
20
Vorbereiten von Indizierungs- und Paired-End-Reagenzien
21
Auftauen von Indizierungs- und Paired-End-Reagenzien
21
Vorbereiten von PRM, PLM2 V2, PAM, PPM, PDR, HP11 und HP14
21
Kapitel 4 Sequenzierung
22
Einleitung
22
Gestaffelte Läufe
22
Sequenzierungsworkflow
22
Eingeben von Laufparametern
23
Überprüfungsbildschirm
25
Laden und Vorfüllen von Reagenzien
25
Laden von SBS-Reagenzien
26
Laden von Indizierungs- und Paired-End-Reagenzien
26
Vorfüllen von Reagenzien
27
Laden der Primer-Fließzelle
28
Positionieren der Röhrchen und Starten des Vorfüllvorgangs
29
Einsetzen der Sequenzierungsfließzelle
30
Entfernen der Gebrauchten Fließzelle
30
Reinigen des Fließzellenhalters
30
Überwachen des Laufs
32
Bericht zur Ersten Base
32
Anzeigen der Laufkennzahlen
33
Durchführen eines Wasserwaschlaufs
33
Entladen von Reagenzien
33
Schnellformatierung der Ausgabe- und Scratch-Laufwerke
35
Kapitel 5 Wartung
36
Einleitung
36
Präventive Wartung
36
Durchführen eines Wartungswaschlaufs
36
Vorbereiten der Lösung für den Wartungswaschlauf
39
Versetzen des Geräts in den Leerlauf
41
Ausschalten des Geräts
42
Anhang A Fehlerbehebung
43
Protokolldatei
43
Mögliche Probleme bei der Laufkonfiguration
43
Durchführen einer Fluidikprüfung
44
Unterbrechen Bzw. Beenden eines Laufs auf dem Hiseq X-System
44
Wechseln von Reagenzien während des Laufs
45
Gestaffelte Läufe auf Fließzelle a und Fließzelle B
46
Mögliche Primer-Rehybridisierung für Read 1
46
Anhang B Echtzeitanalyse
47
Überblick über die Echtzeitanalyse Echtzeitanalyse-Workflow
47
Eingabedateien
47
Ausgabedateien
47
Fehlerbehandlung
48
Datenübertragung
48
Matrizenbildung
49
Registrierung und Intensitätsextraktion
49
Korrektur der Empirischen Phasierung
49
Cluster nach Filterung
50
Qualitätsbewertung
51
Q-Score-Gruppierung
52
Anhang C Ausgabedateien und -Ordner
53
Sequenzierungsausgabedateien
53
Ordnerstruktur der Ausgabedaten
54
Name und Pfad des Laufordners
54
Plattennummerierung
55
Index
56
Technische Unterstützung
60
Dokument-Nr. 15050091 V07 DEU Material-Nr. 20023569
61
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