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illumina HiSeq 2000 Handbücher
Anleitungen und Benutzerhandbücher für illumina HiSeq 2000. Wir haben
2
illumina HiSeq 2000 Anleitungen zum kostenlosen PDF-Download zur Verfügung: Systemhandbuch, Handbuch
illumina HiSeq 2000 Systemhandbuch (86 Seiten)
Marke:
illumina
| Kategorie:
Messgeräte
| Dateigröße: 0.99 MB
Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
6
Kapitel 1 Überblick
8
Einleitung Weitere Ressourcen Gerätekomponenten Überblick über die Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
8
Weitere Ressourcen
9
Fließzellenkammer
10
Statussymbole
12
Aktivitäts- und Sensoranzeigen
12
Verfügbarer Speicherplatz
13
Überblick über die Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
13
Reagenzien-Kits für den Hiseq V4-Modus
13
Reagenzien-Kits für den Truseq V3-Modus
13
Sequenzierungs-Primer für Nextera-Bibliotheken
14
Kapitel 2 Erste Schritte
15
Starten des Hiseq 2000-Systems
15
Gerätesteuerungscomputer - Best Practices
15
Anpassen der Systemeinstellungen
16
Definieren der Laufordnereinstellungen
16
Festlegen der LIMS-Voreinstellungen
17
Anzeigen und Senden von Gerätedaten
17
Vom Benutzer Bereitzustellende Verbrauchsmaterialien
18
Kapitel 3 Sequenzierung IM Hiseq V4-Modus
19
Einleitung
19
Gestaffelte Läufe
19
Lauftypen für die Hiseq V4-Chemie
19
Hiseq V4-Sequenzierungsworkflow
20
Vorbereiten der Reagenzien
20
Aufteilen von Reagenzien
20
Vorbereiten von SBS-Reagenzien
21
Auftauen von SBS-Reagenzien
21
Vorbereiten von Indizierungsreagenzien
21
Auftauen von Indizierungsreagenzien
21
Vorbereiten von HP9
22
Vorbereiten von Paired-End-Reagenzien
22
Auftauen von Paired-End-Reagenzien
22
Eingeben von Laufparametern
23
Überprüfungsbildschirm
26
Laden und Vorfüllen von Reagenzien
26
Laden von SBS-Reagenzien
26
Laden von Indizierungsreagenzien
27
Laden von Paired-End-Reagenzien
28
Vorfüllen von Reagenzien
28
Laden der Primer-Fließzelle
29
Positionieren der Röhrchen und Starten des Vorfüllvorgangs
30
Einsetzen der Sequenzierungsfließzelle
31
Entfernen der Gebrauchten Fließzelle
31
Reinigen des Fließzellenhalters
31
Reinigen der Fließzelle
31
Überwachen des Laufs
34
Bericht zur Ersten Base
34
Anzeigen der Laufkennzahlen
34
Entladen von Reagenzien
34
Durchführen eines Wasserwaschlaufs
35
Kapitel 4 Sequenzierung IM Truseq V3-Modus
37
Einleitung
37
Lauftypen für die Truseq V3-Chemie
37
Truseq V3-Sequenzierungsworkflow
38
Vorbereiten von Reagenzien für Read 1
39
Vorbereiten von HP2
42
Vorbereiten von HP8 oder HP14
42
Vorbereiten von RMR
42
Eingeben von Laufparametern
42
Laden und Vorfüllen von Reagenzien
46
Einsetzen der Sequenzierungsfließzelle
50
Überwachen des Laufs
54
Vorbereiten von Reagenzien für Read 2
54
Vorbereiten von ICB für Read 2 (kein Index oder Einfacher Index)
55
Vorbereiten von ICB für Read 2 (Doppelter Index)
56
Laden von ICB für Read
57
Entladen von Reagenzien
58
Durchführen eines Wasserwaschlaufs
58
Kapitel 5 Wartung
60
Einleitung
60
Präventive Wartung
60
Durchführen eines Wartungswaschlaufs
60
Vorbereiten der Lösung für den Wartungswaschlauf
60
Tween 20 und Proclin 300
61
Versetzen des Geräts in den Leerlauf
63
Ausschalten des Geräts
63
Anhang A Fehlerbehebung
64
Mögliche Probleme bei der Laufkonfiguration
64
Durchführen einer Fluidikprüfung
65
Basespace ist nicht Verfügbar
65
Anhalten und Fortsetzen eines Laufs
65
Anhalten eines Laufs
66
Fortsetzen eines Angehaltenen Laufs
67
Beispieleinstellungen für das Fortsetzen eines Laufs
67
Unterbrechen eines Laufs
68
Wechseln von Reagenzien während des Laufs
68
Gestaffelte Läufe auf Fließzelle a und Fließzelle B
68
Aufteilen von SBS-Kits
69
Aufteilen eines Kits für 250 Zyklen
69
Aufteilen eines Kits für 200 Zyklen
70
Vorbereiten von ICB
70
Primer-Rehybridisierung
71
Hiseq V4-Fließzelle
71
Truseq V3-Fließzelle
71
Anhang B Echtzeitanalyse
72
Überblick über die Echtzeitanalyse Echtzeitanalyse-Workflow Überwachen der Laufkennzahlen
72
Eingabedateien
72
Ausgabedateien
72
Fehlerbehandlung
73
Datenübertragung
73
Matrizenbildung
73
Registrierung und Intensitätsextraktion
74
Korrektur der Empirischen Phasierung
74
Cluster nach Filterung
75
Qualitätsbewertung
75
Q-Score-Gruppierung
75
Überwachen der Laufkennzahlen
76
Anhang C Ausgabedateien und -Ordner
77
Sequenzierungsausgabedateien
77
Ordnerstruktur der Ausgabedaten
78
Name und Pfad des Laufordners
78
Plattennummerierung
79
Miniaturbilder
80
Index
81
Technische Unterstützung
85
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illumina HiSeq 2000 Handbuch (25 Seiten)
Marke:
illumina
| Kategorie:
Analyseinstrumente
| Dateigröße: 1.85 MB
Inhaltsverzeichnis
Environmental Considerations
2
FCC Compliance
2
Configuration du Système
6
Considérations Environnementales
7
Systemkonfiguration
9
Sicherheitserwägungen und Markierungen
9
Laser-Sicherheitshinweis
9
Umgebungsanforderungen
10
Produkt-Zertifizierungen und -Compliance
10
Warnung Bezüglich Schwerer Gegenstände
10
Compliance- und Regulierungsetiketten
10
Beschränkung der Verwendung Bestimmter Gefährlicher Stoffe (Rohs)
10
Configurazione del Sistema
12
Etichetta DI Sicurezza
14
Конфигурация Системы
17
Configuración del Sistema
20
Consideraciones Medioambientales
21
Revision History
24
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