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HiSeq 2000 Systemhandbuch
Eingeben von Laufparametern
Starten Sie die Laufkonfiguration, indem Sie Laufparameter für eine Reihe von Bildschirmen auf der
Registerkarte „Run Configuration" (Laufkonfiguration) eingeben. Die Software führt Sie durch jeden
Bildschirm, wenn Sie die BaseSpace Sequence Hub-Konnektivität angeben, Verbrauchsmaterial-IDs
eintragen, Indizierungsoptionen auswählen und weitere Parameter angeben.
Bildschirm „Integration"
Der Bildschirm „Integration" ermöglicht Ihnen, den Lauf mit BaseSpace Sequence Hub zu verbinden.
1
Wählen Sie im Begrüßungsbildschirm Sequence | New Run (Sequenzieren | Neuer Lauf), um den
Bildschirm „Integration" zu öffnen.
2
[Optional]
Stellen Sie wie folgt eine Verbindung zu BaseSpace Sequence Hub her.
a
Wählen Sie BaseSpace.
b Wählen Sie aus den folgenden BaseSpace-Optionen aus:
Storage and Analysis (Speicherung und Analyse): Sendet zwecks Remote-Überwachung und
u
Datenanalyse Laufdaten an BaseSpace Sequence Hub. Zur Verwendung dieser Option ist ein
Probenblatt erforderlich.
Run Monitoring Only (Nur Laufüberwachung): Sendet nur InterOp-Dateien an
u
BaseSpace Sequence Hub, was die Remote-Überwachung des Laufs ermöglicht.
c
Melden Sie sich mit der E-Mail-Adresse Ihres MyIllumina-Kontos und Ihrem Kennwort bei
BaseSpace Sequence Hub an.
3
[Optional]
Um fortzufahren, ohne den Lauf mit BaseSpace Sequence Hub zu verbinden, wählen Sie None
(Keine).
4
Wählen Sie Next (Weiter).
Bildschirm „Storage" (Speicherung)
1
Aktivieren Sie das Kontrollkästchen Save to an output folder (In einem Ausgabeordner speichern) und
wählen Sie dann Browse (Durchsuchen), um zu einem bevorzugten Netzwerkspeicherort zu navigieren.
Wenn der Lauf für Zwecke der Speicherung und Analyse mit BaseSpace Sequence Hub verbunden ist,
ist dieser Schritt optional.
2
Wählen Sie Zip BCL files (BCL-Dateien zippen), um den erforderlichen Festplattenspeicherplatz zu
reduzieren.
Wenn der Lauf mit BaseSpace Sequence Hub verbunden ist, ist die Option Zip BCL files (BCL-Dateien
zippen) standardmäßig aktiviert.
HINWEIS
Die Option Bin Q-Scores (Q-Scores gruppieren) ist standardmäßig aktiviert, um den benötigten
Speicherplatz zu reduzieren. Diese Option fasst Qualitätsbewertungen über einen größeren Bereich von
Werten zusammen, ohne die Genauigkeit oder die Leistung zu beeinträchtigen.
3
Wählen Sie unter „Save Auxiliary Files" (Zusatzdateien speichern) aus den folgenden Optionen aus:
Save All Thumbnails (Alle Miniaturbilder speichern): Speichert alle Miniaturbilder. Ein Miniaturbild ist
u
eine Auswahl von Bildern aus vielen Platten in jeder Plattenspalte bzw. in jedem Bildstreifen, die in
einem Miniaturbild zusammengefasst werden.
Dokument-Nr. 15011190 v02 DEU
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in Diagnoseverfahren.
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