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iSeq 100-Sequenzierungssystem Handbuch
Geben Sie im Feld „Sample Sheet" (Probenblatt) den Speicherort für das Probenblatt ein oder
u
wählen Sie Browse (Durchsuchen) und navigieren Sie zum gewünschten Speicherort. Der Name des
Probenblatts muss „SampleSheet.csv" lauten.
5
Wählen Sie Pre-Run Check (Selbsttest), um den Selbsttest zu starten.
Anzahl der Zyklen in einem Read
Die Eingabe von mindestens 26 Zyklen und maximal 151 Zyklen pro Read hilft, die Datenqualität
sicherzustellen. Die genaue Anzahl der Zyklen hängt von Ihrem Versuch ab.
Die minimale und maximale Zykluszahl beinhaltet einen zusätzlichen Zyklus. Fügen Sie immer einen Zyklus zur
gewünschten Read-Länge hinzu, um die Auswirkungen von Phasierung und Vorphasierung zu korrigieren.
Die Read-Länge ist die Anzahl der Sequenzierungs -Zyklen in Read 1 und Read 2. Nicht berücksichtigt sind
zusätzliche Zyklen und Indexzyklen.
Beispiel für eine Laufkonfiguration:
Für eine Read-Länge von 36 (Single-Read) geben Sie 37 in das Feld „Read 1" ein.
u
Für eine Read-Länge von 150 pro Read (Paired-End) geben Sie 151 in das Feld „Read 1" und 151 in
u
das Feld „Read 2" ein.
Überprüfen der Selbsttests
Selbsttests beinhalten eine Geräte- und eine Flussprüfung. Bei der Flussprüfung werden die
Kartuschendichtungen durchstoßen und das Reagenz durch die Fließzelle geleitet. Daher können
Verbrauchsmaterialien nach dem Start der Flussprüfung nicht wiederverwendet werden.
Die Flussprüfung folgt auf die Geräteprüfung. Wenn eine Prüfung läuft, wird der Balken für diese Prüfung
animiert.
1
Warten Sie etwa 15 Minuten, bis die Selbsttests abgeschlossen sind.
Nach erfolgreichem Abschluss startet der Lauf automatisch.
VORSICHT
Das Öffnen der Klappe während des Selbsttests oder des Laufs kann zum Fehlschlagen des Laufs
führen.
2
Wenn während der Geräteprüfung ein Fehler auftritt, wählen Sie Retry (Wiederholen), um die Prüfung
erneut durchzuführen.
Informationen zur Behebung wiederkehrender Fehler finden Sie unter
Seite
40.
Überwachen des Lauffortschritts
1
Überwachen Sie den Ausführungsfortschritt des Laufs und die Kennzahlen, die auf dem
Sequenzierungsbildschirm angezeigt werden.
Estimated run completion (Geschätzter Abschluss des Laufs): Das ungefähre Datum und die
u
ungefähre Uhrzeit für den Abschluss des Laufs.
%Q30 Read 1: Der Prozentsatz der Base-Calls in Read 1 mit einem Q-Score ≥ 30.
u
%Q30 Read 2: Der Prozentsatz der Base-Calls in Read 2 mit einem Q-Score ≥ 30.
u
Projected Total Yield (Erwartetes Gesamtergebnis): Die erwartete Anzahl von Base-Calls für
u
den Lauf.
Der Q30-Wert und die Ergebniskennzahlen werden nach Zyklus 26 angezeigt.
Dokument-Nr. 1000000036024 v00 DEU
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung in Diagnoseverfahren.
Beheben von Fehlermeldungen auf
30
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Kapitel
Inhaltsverzeichnis
Fehlerbehebung
